More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1591 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 		 305 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.77 
 
 		 301 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.11 
 
 		 301 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.11 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.78 
 
 		 301 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.78 
 
 		 301 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.96 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.13 
 
 		 301 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.47 
 
 		 305 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.77 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.13 
 
 		 301 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.02 
 
 		 302 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.23 
 
 		 301 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.8 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.25 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.75 
 
 		 290 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.17 
 
 		 334 aa  298  9e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.47 
 
 		 333 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 338 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.76 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.06 
 
 		 284 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.32 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.48 
 
 		 286 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.41 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.41 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.2 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.2 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  51.65 
 
 		 266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  56.83 
 
 		 197 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 181 aa  215  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  55 
 
 		 184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  56.9 
 
 		 178 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  56.07 
 
 		 183 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  55.11 
 
 		 182 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  54.91 
 
 		 185 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50.83 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  51.69 
 
 		 180 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  55.75 
 
 		 186 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  55.75 
 
 		 186 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 		 186 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 		 186 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 182 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  55.93 
 
 		 186 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  52.78 
 
 		 182 aa  205  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  55.17 
 
 		 186 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  55.17 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  57.32 
 
 		 178 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  48.89 
 
 		 201 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 185 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 185 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  55.68 
 
 		 185 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  55.49 
 
 		 186 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  54.34 
 
 		 180 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 		 182 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  59.88 
 
 		 184 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  54.91 
 
 		 186 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  55.09 
 
 		 176 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  51.72 
 
 		 190 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.54 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  55.23 
 
 		 175 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  53.37 
 
 		 183 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 		 180 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 		 177 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 		 204 aa  198  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  54.6 
 
 		 182 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  53.98 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  53.76 
 
 		 191 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  57.56 
 
 		 175 aa  197  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  54.95 
 
 		 184 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  55.81 
 
 		 177 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 181 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 181 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  52.35 
 
 		 178 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  52.54 
 
 		 191 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  52.33 
 
 		 179 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 180 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 182 aa  193  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  53.29 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  51.74 
 
 		 179 aa  192  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.43 
 
 		 180 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 182 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 176 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  51.12 
 
 		 181 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  52.51 
 
 		 195 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  48.62 
 
 		 183 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  51.09 
 
 		 186 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  47.59 
 
 		 209 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 		 179 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  49.42 
 
 		 180 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  52.25 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 177 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  51.38 
 
 		 189 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 		 180 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>