More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1949 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 		 351 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.73 
 
 		 290 aa  358  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.82 
 
 		 334 aa  356  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.01 
 
 		 333 aa  342  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.57 
 
 		 334 aa  342  8e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.27 
 
 		 284 aa  341  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.18 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.17 
 
 		 287 aa  331  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.16 
 
 		 284 aa  308  9e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.83 
 
 		 286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.83 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.53 
 
 		 289 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.69 
 
 		 306 aa  296  5e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.82 
 
 		 289 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.32 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.1 
 
 		 301 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.75 
 
 		 301 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.39 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.03 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.91 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.3 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.3 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.64 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.52 
 
 		 301 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.63 
 
 		 301 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.37 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.37 
 
 		 302 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.3 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.03 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.92 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.89 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 		 173 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 156 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  70.8 
 
 		 124 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  49.71 
 
 		 169 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  65.79 
 
 		 119 aa  173  5e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  64.91 
 
 		 119 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  64.04 
 
 		 119 aa  172  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  67.26 
 
 		 159 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  53.5 
 
 		 158 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  59.86 
 
 		 160 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  51.92 
 
 		 181 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2423  methionine sulfoxide reductase B  62.81 
 
 		 122 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55047  normal  0.248958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  62.93 
 
 		 121 aa  169  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  55.32 
 
 		 178 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  47.59 
 
 		 213 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  51.48 
 
 		 209 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  66.37 
 
 		 124 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 		 163 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2243  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 		 173 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  46.56 
 
 		 212 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 182 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.3 
 
 		 165 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  53.21 
 
 		 177 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 		 162 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  46.74 
 
 		 212 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  53.02 
 
 		 155 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  46.74 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  46.74 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  46.74 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  55.63 
 
 		 262 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  46.74 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  46.74 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  60.53 
 
 		 120 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  46.74 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  52.23 
 
 		 219 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 181 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  45.81 
 
 		 162 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  47.8 
 
 		 164 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 		 173 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  44.39 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 		 178 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 		 184 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 228 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 220 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.03 
 
 		 180 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 212 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  52.7 
 
 		 178 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  46.78 
 
 		 173 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  48.47 
 
 		 176 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  44.57 
 
 		 213 aa  156  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  50.69 
 
 		 180 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  44.91 
 
 		 213 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 150 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  41.98 
 
 		 201 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  50.33 
 
 		 162 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 217 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  47.85 
 
 		 178 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 		 177 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 212 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 		 168 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  44.02 
 
 		 212 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  50.66 
 
 		 180 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  47.02 
 
 		 168 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  45.83 
 
 		 168 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 		 214 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>