More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1095 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 178 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  84.48 
 
 		 179 aa  311  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 		 173 aa  281  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  74.85 
 
 		 168 aa  278  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  76.69 
 
 		 169 aa  278  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  74.55 
 
 		 171 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  74.55 
 
 		 171 aa  276  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 		 169 aa  276  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  76.05 
 
 		 168 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  74.55 
 
 		 171 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  74.25 
 
 		 168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  73.21 
 
 		 168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  74.25 
 
 		 168 aa  271  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  73.46 
 
 		 182 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  73.33 
 
 		 172 aa  270  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  69.88 
 
 		 168 aa  268  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  73.62 
 
 		 169 aa  267  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  74.69 
 
 		 169 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  74.69 
 
 		 169 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  74.1 
 
 		 172 aa  265  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  72.94 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  71.69 
 
 		 168 aa  263  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  70.59 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  74.25 
 
 		 172 aa  263  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  72.89 
 
 		 169 aa  260  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  70.48 
 
 		 171 aa  260  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  71.69 
 
 		 170 aa  259  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  69.09 
 
 		 175 aa  256  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  70.99 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  71.76 
 
 		 177 aa  253  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  70.81 
 
 		 171 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  69.33 
 
 		 167 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  72.5 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  67.66 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  65.84 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  67.7 
 
 		 166 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  64.38 
 
 		 162 aa  228  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  62.26 
 
 		 168 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.88 
 
 		 311 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.36 
 
 		 322 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 162 aa  158  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.88 
 
 		 351 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  46.75 
 
 		 213 aa  147  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  45.1 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44.3 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 333 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 229 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  44.89 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  41.61 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 284 aa  141  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  44.77 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  44.19 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.1 
 
 		 287 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.37 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  47.06 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  41.67 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  44.77 
 
 		 212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.95 
 
 		 338 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  41.36 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  137  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  44.85 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.59 
 
 		 334 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  46.26 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 246 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  45.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  43.95 
 
 		 236 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.87 
 
 		 290 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  43.79 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.56 
 
 		 334 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.24 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.9 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  46.26 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  43.59 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 		 212 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  42.31 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  43.23 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  44.94 
 
 		 212 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  41.72 
 
 		 242 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  43.95 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  45.21 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  42.68 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.67 
 
 		 284 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  44.14 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  44.08 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  43.11 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  42.33 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 		 238 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  44.52 
 
 		 235 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 		 214 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>