More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0822 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 166 aa  349  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  74.7 
 
 		 166 aa  274  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  75.9 
 
 		 169 aa  273  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  73.78 
 
 		 172 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  73.78 
 
 		 172 aa  264  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  73.17 
 
 		 166 aa  262  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  75.31 
 
 		 169 aa  260  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  74.85 
 
 		 169 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  74.53 
 
 		 168 aa  259  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  71.78 
 
 		 170 aa  256  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  72.89 
 
 		 169 aa  256  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  70.91 
 
 		 171 aa  255  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  71.78 
 
 		 179 aa  254  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  71.6 
 
 		 171 aa  250  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  69.94 
 
 		 175 aa  249  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 168 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  69.7 
 
 		 172 aa  248  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  71.25 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  68.52 
 
 		 168 aa  245  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  68.07 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  67.48 
 
 		 168 aa  244  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 173 aa  244  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  68.12 
 
 		 182 aa  243  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 168 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  72.67 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  68.1 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  66.05 
 
 		 162 aa  239  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  68.94 
 
 		 171 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  68.94 
 
 		 171 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  68.32 
 
 		 171 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  67.08 
 
 		 169 aa  233  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  67.7 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 179 aa  231  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  65.84 
 
 		 169 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  63.35 
 
 		 167 aa  224  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  62.11 
 
 		 167 aa  223  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  60.84 
 
 		 168 aa  221  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.13 
 
 		 311 aa  207  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.5 
 
 		 322 aa  174  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  46.58 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 290 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  40.62 
 
 		 242 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  42.24 
 
 		 229 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  43.12 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  40.96 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  44.74 
 
 		 184 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.31 
 
 		 338 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  39.35 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  43.31 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  42.04 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 		 181 aa  134  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.31 
 
 		 333 aa  133  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  43.71 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  43.51 
 
 		 186 aa  133  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  42.31 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  44.22 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  42.76 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  42.04 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  40.94 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  44.79 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.83 
 
 		 305 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.51 
 
 		 334 aa  131  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.87 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  40.25 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  41.94 
 
 		 197 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04210  protein-methionine-S-oxide reductase, putative  39.39 
 
 		 192 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  42.11 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.59 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  41.72 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  42.11 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  38.22 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  41.45 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.79 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  42.76 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  38.75 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  42.48 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.56 
 
 		 351 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  39.49 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.03 
 
 		 287 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  44.3 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 		 212 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 		 182 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  42.76 
 
 		 238 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  40.4 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  40.13 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  39.62 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>