More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6171 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
169 aa  352  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  97.04 
 
 
169 aa  346  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  81.66 
 
 
169 aa  302  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  82.72 
 
 
168 aa  295  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  78.7 
 
 
172 aa  295  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  81.48 
 
 
168 aa  292  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  80.25 
 
 
168 aa  291  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  80.86 
 
 
168 aa  290  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  87.65 
 
 
177 aa  287  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  80.61 
 
 
172 aa  286  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  81.82 
 
 
172 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  80.61 
 
 
179 aa  286  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  80.25 
 
 
168 aa  285  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  79.29 
 
 
170 aa  285  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  77.38 
 
 
171 aa  284  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  80.72 
 
 
169 aa  284  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  81.6 
 
 
168 aa  283  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 
173 aa  283  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  77.11 
 
 
175 aa  280  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  75.61 
 
 
182 aa  279  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  76.51 
 
 
179 aa  277  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  75.45 
 
 
179 aa  274  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  74.25 
 
 
168 aa  271  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  75.76 
 
 
169 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  75.76 
 
 
169 aa  270  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  76.54 
 
 
171 aa  268  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  76.54 
 
 
171 aa  268  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  75.93 
 
 
171 aa  267  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  74.69 
 
 
178 aa  266  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  76.36 
 
 
179 aa  266  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  76.88 
 
 
171 aa  266  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  75.9 
 
 
166 aa  263  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  72.39 
 
 
166 aa  256  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  72.89 
 
 
166 aa  256  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  73.46 
 
 
167 aa  256  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 
162 aa  256  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 
167 aa  254  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  62.05 
 
 
168 aa  234  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.47 
 
 
311 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.46 
 
 
322 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  49.07 
 
 
162 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.06 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
229 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 
180 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
182 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46.78 
 
 
186 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
184 aa  151  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 
155 aa  151  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  48.45 
 
 
178 aa  151  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  46.84 
 
 
186 aa  150  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  46.15 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
186 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 
180 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
183 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.5 
 
 
197 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  43.37 
 
 
213 aa  148  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.13 
 
 
287 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.75 
 
 
180 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
183 aa  147  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.59 
 
 
176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  46.79 
 
 
156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  48.45 
 
 
195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  46.5 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  44.3 
 
 
242 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.81 
 
 
290 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.69 
 
 
183 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
181 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  42.53 
 
 
182 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 
185 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.81 
 
 
338 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.23 
 
 
225 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  42.53 
 
 
182 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  43.67 
 
 
181 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
181 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  47.65 
 
 
225 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  43.95 
 
 
228 aa  141  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.87 
 
 
333 aa  140  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 
162 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  43.31 
 
 
179 aa  140  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  48.34 
 
 
210 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  44.23 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  44.16 
 
 
180 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  42.68 
 
 
209 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  45.22 
 
 
179 aa  138  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.21 
 
 
334 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.31 
 
 
228 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 
236 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  45.33 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  43.12 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  44.24 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.12 
 
 
179 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
216 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
179 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 
180 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  43.79 
 
 
182 aa  137  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>