More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4557 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 168 aa  354  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  89.29 
 
 		 168 aa  327  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  89.29 
 
 		 168 aa  324  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 		 168 aa  320  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  85.12 
 
 		 168 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  82.14 
 
 		 172 aa  301  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  82.72 
 
 		 169 aa  294  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  78.31 
 
 		 173 aa  294  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  80.25 
 
 		 169 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  80.25 
 
 		 169 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  78.44 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  81.55 
 
 		 177 aa  288  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  80.62 
 
 		 168 aa  286  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  75.45 
 
 		 179 aa  283  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  78.4 
 
 		 169 aa  283  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 		 182 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  76.05 
 
 		 179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 		 172 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 172 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  76.79 
 
 		 170 aa  280  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 		 168 aa  279  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 		 171 aa  278  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  75.93 
 
 		 179 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  76.69 
 
 		 171 aa  276  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  74.85 
 
 		 178 aa  271  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  76.69 
 
 		 171 aa  270  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  76.69 
 
 		 171 aa  270  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  75.78 
 
 		 169 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  76.07 
 
 		 171 aa  269  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  75.78 
 
 		 169 aa  269  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  75.93 
 
 		 179 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  70.06 
 
 		 167 aa  261  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  70.44 
 
 		 162 aa  258  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  73.46 
 
 		 166 aa  257  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  68.12 
 
 		 168 aa  250  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 166 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  64.07 
 
 		 167 aa  248  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.94 
 
 		 311 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.66 
 
 		 322 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  52.5 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.3 
 
 		 197 aa  160  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  48.81 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 229 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.34 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 		 333 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.84 
 
 		 287 aa  152  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.62 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  47.8 
 
 		 208 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.99 
 
 		 351 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  48.05 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 		 338 aa  150  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 183 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.65 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  44.1 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.1 
 
 		 225 aa  147  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  48 
 
 		 236 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 242 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  43.86 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 		 290 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 		 235 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  43.56 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  49.34 
 
 		 212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  42.59 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.06 
 
 		 334 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.31 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 213 aa  143  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  45.61 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 		 240 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.87 
 
 		 334 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  46.85 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  44.77 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  45.86 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.22 
 
 		 284 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  40.12 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  47.77 
 
 		 221 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  43.31 
 
 		 179 aa  140  8e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0621  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  47.02 
 
 		 212 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  44.94 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.05 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  41.77 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  44.87 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.87 
 
 		 284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  45.03 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>