More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4158 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 167 aa  348  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  73.65 
 
 		 168 aa  266  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  72.46 
 
 		 168 aa  266  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  72.46 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  73.75 
 
 		 172 aa  263  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  70.06 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  69.46 
 
 		 168 aa  260  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  72.84 
 
 		 169 aa  256  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  73.46 
 
 		 169 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  69.46 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  68.86 
 
 		 175 aa  255  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  69.51 
 
 		 173 aa  254  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  72.56 
 
 		 168 aa  254  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  70.73 
 
 		 168 aa  253  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  71.34 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  71.95 
 
 		 169 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  72.39 
 
 		 172 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  70.73 
 
 		 170 aa  250  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  72.39 
 
 		 172 aa  250  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  67.48 
 
 		 182 aa  249  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  68.71 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  70.55 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  71.86 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  70.99 
 
 		 169 aa  247  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  70.99 
 
 		 171 aa  247  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  70.99 
 
 		 171 aa  247  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  70.99 
 
 		 169 aa  246  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 		 171 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  68.52 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  67.66 
 
 		 167 aa  243  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  68.29 
 
 		 171 aa  240  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  67.92 
 
 		 166 aa  238  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  65.62 
 
 		 162 aa  233  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  65.27 
 
 		 171 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  63.35 
 
 		 166 aa  224  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  62.5 
 
 		 168 aa  222  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  62.89 
 
 		 166 aa  221  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.97 
 
 		 311 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.09 
 
 		 322 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 		 162 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.04 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.63 
 
 		 338 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.47 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.53 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  47.02 
 
 		 180 aa  157  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  47.34 
 
 		 213 aa  157  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  45.78 
 
 		 228 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 		 229 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.95 
 
 		 334 aa  153  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.41 
 
 		 333 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.04 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.5 
 
 		 287 aa  152  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.17 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  51.39 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 		 236 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  47.8 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  44.31 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  45 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 208 aa  148  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 		 242 aa  147  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.1 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  45.45 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  46.54 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.47 
 
 		 290 aa  147  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 		 178 aa  147  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44.1 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.1 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  43.23 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.58 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  44.85 
 
 		 182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  45.89 
 
 		 150 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.3 
 
 		 197 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 		 228 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  46.21 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  43.48 
 
 		 225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  46.88 
 
 		 211 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.13 
 
 		 334 aa  143  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  43.95 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  46.88 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  44.65 
 
 		 173 aa  141  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.98 
 
 		 351 aa  140  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  46.26 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  45.33 
 
 		 236 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  43.95 
 
 		 214 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04210  protein-methionine-S-oxide reductase, putative  43.29 
 
 		 192 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  41.98 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  41.98 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  46.25 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>