More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2452 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
158 aa  335  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  66.67 
 
 
156 aa  229  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  64.29 
 
 
164 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  63.09 
 
 
150 aa  210  7e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  62.16 
 
 
162 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  61.33 
 
 
181 aa  204  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  63.87 
 
 
162 aa  203  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  58.97 
 
 
165 aa  199  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  61.04 
 
 
162 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  63.09 
 
 
165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
181 aa  192  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
228 aa  190  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 
185 aa  189  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.33 
 
 
290 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 
177 aa  187  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  53.9 
 
 
184 aa  186  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  58.71 
 
 
159 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  55.7 
 
 
155 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  58.71 
 
 
159 aa  185  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  58.71 
 
 
159 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  58.71 
 
 
159 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  53.9 
 
 
266 aa  184  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  53.21 
 
 
208 aa  184  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 
163 aa  184  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 
180 aa  183  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 
178 aa  183  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  59.15 
 
 
210 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
159 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
159 aa  181  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 
225 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  56.77 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  55.94 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
159 aa  180  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 
159 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  57.42 
 
 
164 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  50.66 
 
 
180 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
197 aa  179  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 
178 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 
159 aa  178  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
158 aa  179  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  54.42 
 
 
153 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
182 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  56.69 
 
 
160 aa  177  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  55.33 
 
 
211 aa  176  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
186 aa  176  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
159 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
175 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 
183 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.65 
 
 
186 aa  175  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.32 
 
 
301 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  52.23 
 
 
184 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  51.32 
 
 
184 aa  172  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  53.29 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  55.03 
 
 
212 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  51.27 
 
 
186 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
186 aa  170  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 
180 aa  170  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
182 aa  170  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  50.94 
 
 
195 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.36 
 
 
300 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.5 
 
 
351 aa  170  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 
157 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  49.06 
 
 
186 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  49.06 
 
 
186 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.27 
 
 
333 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  49.35 
 
 
176 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  51.3 
 
 
178 aa  169  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
334 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 
159 aa  168  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
228 aa  168  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  51.59 
 
 
173 aa  168  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 
178 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
190 aa  167  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.27 
 
 
338 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.28 
 
 
305 aa  167  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 
180 aa  167  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
214 aa  167  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
177 aa  167  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
219 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  52.67 
 
 
211 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  52.67 
 
 
157 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.570537  decreased coverage  0.0000698173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.36 
 
 
322 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  49.37 
 
 
191 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  49.04 
 
 
186 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  52.6 
 
 
177 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  52.45 
 
 
245 aa  165  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  53.69 
 
 
243 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  47.17 
 
 
186 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 
182 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  47.17 
 
 
186 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
209 aa  164  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  49.35 
 
 
182 aa  164  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 
183 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>