More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3784 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 162 aa  342  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  75.31 
 
 		 168 aa  267  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 168 aa  259  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  70.44 
 
 		 168 aa  258  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 168 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  72.5 
 
 		 171 aa  256  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 169 aa  257  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  71.25 
 
 		 168 aa  256  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 169 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  69.57 
 
 		 168 aa  256  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 		 170 aa  254  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  68.52 
 
 		 169 aa  254  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  69.14 
 
 		 172 aa  253  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  68.52 
 
 		 172 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  70 
 
 		 169 aa  250  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  68.32 
 
 		 182 aa  249  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  71.43 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  68.12 
 
 		 168 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  69.38 
 
 		 173 aa  248  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  70 
 
 		 175 aa  248  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  68.52 
 
 		 172 aa  247  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  68.52 
 
 		 168 aa  246  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  68.12 
 
 		 171 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  67.3 
 
 		 171 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  67.3 
 
 		 171 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  67.3 
 
 		 171 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  67.92 
 
 		 169 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  66.67 
 
 		 166 aa  240  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  67.9 
 
 		 179 aa  240  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  67.3 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  66.05 
 
 		 166 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  66.25 
 
 		 167 aa  237  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  65.41 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  64.2 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  65.62 
 
 		 167 aa  233  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  63.58 
 
 		 166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  64.15 
 
 		 178 aa  226  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  63.75 
 
 		 179 aa  223  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.16 
 
 		 311 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.09 
 
 		 322 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  51.55 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  52.9 
 
 		 197 aa  161  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  51.32 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 184 aa  159  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 		 155 aa  157  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.72 
 
 		 333 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.28 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  43.83 
 
 		 242 aa  153  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.32 
 
 		 338 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 		 181 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.72 
 
 		 290 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  46.99 
 
 		 213 aa  151  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  49.33 
 
 		 180 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50.66 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  46.01 
 
 		 229 aa  151  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 		 182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  52.23 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  47.77 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  51.03 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 		 287 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.41 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.24 
 
 		 334 aa  147  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  50.62 
 
 		 186 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 		 225 aa  147  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  46.3 
 
 		 234 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  49.69 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  45.39 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 		 179 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.13 
 
 		 334 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  45.06 
 
 		 246 aa  144  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 209 aa  144  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 284 aa  143  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  45.03 
 
 		 236 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.15 
 
 		 180 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.57 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 		 228 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.22 
 
 		 284 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.2 
 
 		 284 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 		 212 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  45.39 
 
 		 225 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  45.62 
 
 		 183 aa  140  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  43.56 
 
 		 173 aa  140  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  45.28 
 
 		 198 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  45.96 
 
 		 191 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  44.87 
 
 		 180 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 		 211 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>