More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1002 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 167 aa  348  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  72.39 
 
 		 170 aa  261  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 		 169 aa  257  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  68.1 
 
 		 169 aa  256  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  69.09 
 
 		 182 aa  256  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 		 169 aa  254  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  68.52 
 
 		 171 aa  254  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  66.47 
 
 		 168 aa  254  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  69.51 
 
 		 168 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  68.9 
 
 		 169 aa  252  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  69.09 
 
 		 171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  66.87 
 
 		 172 aa  251  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  66.47 
 
 		 168 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  65.27 
 
 		 175 aa  250  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  69.14 
 
 		 178 aa  249  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  64.07 
 
 		 168 aa  248  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  67.9 
 
 		 169 aa  248  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  68.86 
 
 		 177 aa  247  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  65.27 
 
 		 168 aa  246  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  65.43 
 
 		 179 aa  246  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  66.27 
 
 		 173 aa  246  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  67.88 
 
 		 179 aa  244  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  63.47 
 
 		 168 aa  244  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  66.67 
 
 		 169 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  67.66 
 
 		 167 aa  243  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  68.1 
 
 		 172 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  68.1 
 
 		 179 aa  241  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  65.85 
 
 		 168 aa  242  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  64.2 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  64.2 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  64.07 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  64.2 
 
 		 171 aa  239  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  66.87 
 
 		 172 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  65 
 
 		 166 aa  237  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  66.25 
 
 		 162 aa  237  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  65 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  62.11 
 
 		 166 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  62.26 
 
 		 168 aa  223  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.9 
 
 		 311 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.6 
 
 		 322 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 		 183 aa  157  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.53 
 
 		 333 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  46.94 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46.31 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 		 189 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.34 
 
 		 184 aa  151  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.63 
 
 		 338 aa  150  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  42.11 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.58 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.47 
 
 		 287 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.44 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.26 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.81 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  43.53 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 		 204 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  47.68 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.69 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  44.65 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  44.1 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.44 
 
 		 290 aa  143  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.68 
 
 		 334 aa  143  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  43.84 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 277 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  43.21 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  43.51 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.68 
 
 		 284 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.12 
 
 		 284 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  39.75 
 
 		 179 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 		 262 aa  141  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  45.83 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  42.68 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.68 
 
 		 334 aa  141  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.28 
 
 		 351 aa  140  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.68 
 
 		 284 aa  140  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 299 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 293 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.59 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 287 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 287 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  44.59 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  45.22 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  42.77 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 		 186 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  44.14 
 
 		 229 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 208 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>