More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4156 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
168 aa  353  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  89.29 
 
 
168 aa  327  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  86.9 
 
 
168 aa  322  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  87.5 
 
 
168 aa  320  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  85.71 
 
 
172 aa  307  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  83.93 
 
 
168 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  81.33 
 
 
173 aa  297  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  79.64 
 
 
175 aa  294  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  82.82 
 
 
169 aa  294  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  80.86 
 
 
169 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  80.86 
 
 
169 aa  290  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  82.14 
 
 
177 aa  289  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  79.75 
 
 
169 aa  288  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  78.66 
 
 
172 aa  287  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  76.97 
 
 
182 aa  286  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  79.14 
 
 
168 aa  286  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  77.25 
 
 
179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  79.88 
 
 
172 aa  284  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  79.88 
 
 
171 aa  283  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  75.45 
 
 
179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  76.79 
 
 
170 aa  278  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  77.44 
 
 
168 aa  277  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 
171 aa  277  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  76.07 
 
 
178 aa  275  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  75.93 
 
 
179 aa  274  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  76.07 
 
 
179 aa  270  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  76.4 
 
 
169 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  73.49 
 
 
169 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  74.1 
 
 
171 aa  267  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  74.1 
 
 
171 aa  267  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  74.1 
 
 
171 aa  267  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  72.46 
 
 
167 aa  265  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  69.57 
 
 
162 aa  256  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  73.75 
 
 
166 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  66.47 
 
 
167 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  71.25 
 
 
166 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  67.92 
 
 
168 aa  244  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  69.38 
 
 
166 aa  244  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.58 
 
 
311 aa  222  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 
162 aa  187  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.17 
 
 
322 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45 
 
 
182 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  45.56 
 
 
186 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  45.96 
 
 
183 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.06 
 
 
197 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  48.1 
 
 
178 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  46.91 
 
 
242 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  46.47 
 
 
213 aa  154  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 
229 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.03 
 
 
186 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  48.05 
 
 
180 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  48.68 
 
 
184 aa  152  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.43 
 
 
351 aa  151  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.57 
 
 
287 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.13 
 
 
338 aa  149  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.06 
 
 
183 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.24 
 
 
334 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
183 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.51 
 
 
333 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.86 
 
 
182 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 
155 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  44.17 
 
 
182 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  45 
 
 
180 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 
181 aa  147  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
150 aa  147  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  43.31 
 
 
180 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  48.68 
 
 
236 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
208 aa  147  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 
284 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.94 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 
284 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.48 
 
 
228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.59 
 
 
184 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.22 
 
 
290 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 
284 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 
225 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 
235 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.22 
 
 
334 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  45.45 
 
 
182 aa  143  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
181 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
181 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  42.33 
 
 
182 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  39.51 
 
 
179 aa  143  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  45.93 
 
 
212 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  46.26 
 
 
163 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 
209 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 
180 aa  141  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  46.3 
 
 
182 aa  140  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  40.76 
 
 
180 aa  140  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  41.77 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  47.74 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  47.3 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  41.4 
 
 
184 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  45.34 
 
 
186 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  47.02 
 
 
240 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  45.34 
 
 
186 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  45.34 
 
 
186 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>