More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2804 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 171 aa  360  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  81.55 
 
 		 170 aa  298  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  83.13 
 
 		 168 aa  296  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  81.55 
 
 		 169 aa  293  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  76.19 
 
 		 169 aa  288  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  77.38 
 
 		 169 aa  284  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 179 aa  284  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 168 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 		 168 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  76.79 
 
 		 169 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  75.76 
 
 		 173 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  75.6 
 
 		 172 aa  279  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  74.7 
 
 		 182 aa  278  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 		 168 aa  278  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 		 168 aa  277  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  75.3 
 
 		 168 aa  277  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  74.4 
 
 		 172 aa  276  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  75.45 
 
 		 175 aa  276  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  75.15 
 
 		 168 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  73.81 
 
 		 171 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  71.43 
 
 		 172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  72.78 
 
 		 171 aa  269  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  72.78 
 
 		 171 aa  269  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  72.78 
 
 		 171 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  77.64 
 
 		 166 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  71.01 
 
 		 179 aa  267  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  74.1 
 
 		 169 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  76.79 
 
 		 177 aa  263  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  73.01 
 
 		 166 aa  261  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  69.41 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  71.69 
 
 		 169 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  70.3 
 
 		 178 aa  258  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  72.5 
 
 		 162 aa  256  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  70.91 
 
 		 166 aa  255  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  71.78 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  69.09 
 
 		 167 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  68.29 
 
 		 167 aa  240  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  65.84 
 
 		 168 aa  233  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.47 
 
 		 311 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.2 
 
 		 322 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 242 aa  158  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.73 
 
 		 287 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.88 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 		 333 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.89 
 
 		 186 aa  151  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.08 
 
 		 290 aa  151  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 		 229 aa  150  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.75 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  47.77 
 
 		 178 aa  150  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.54 
 
 		 338 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.94 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  44.37 
 
 		 150 aa  147  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 		 236 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.77 
 
 		 334 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.86 
 
 		 334 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  45.33 
 
 		 180 aa  143  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  44.31 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.51 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  41.88 
 
 		 180 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  43.64 
 
 		 225 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  41.29 
 
 		 209 aa  140  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.96 
 
 		 351 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  43.48 
 
 		 240 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.44 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  42.04 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  42.2 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.95 
 
 		 228 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  45.39 
 
 		 235 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  41.51 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  42.26 
 
 		 208 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 246 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  45.39 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  41.51 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.04 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  43.71 
 
 		 236 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  43.59 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.51 
 
 		 284 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.67 
 
 		 181 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.95 
 
 		 284 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  46.36 
 
 		 238 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  40.76 
 
 		 179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>