More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0995 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 150 aa  315  1e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  63.09 
 
 		 158 aa  210  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  63.09 
 
 		 181 aa  202  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  61.49 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  60.14 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  60.81 
 
 		 164 aa  201  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  61.22 
 
 		 225 aa  196  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  58.11 
 
 		 208 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 		 162 aa  192  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  59.59 
 
 		 228 aa  189  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 		 178 aa  188  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  58.78 
 
 		 165 aa  187  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  56.76 
 
 		 162 aa  186  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  58.11 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  55.41 
 
 		 180 aa  184  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  59.86 
 
 		 212 aa  185  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  56.16 
 
 		 197 aa  185  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  57.05 
 
 		 153 aa  183  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  56.76 
 
 		 185 aa  183  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  57.53 
 
 		 228 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  55.78 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  59.86 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.53 
 
 		 311 aa  180  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  53.74 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  53.38 
 
 		 186 aa  177  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  52.7 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  56.46 
 
 		 177 aa  177  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  58.5 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  58.5 
 
 		 159 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 159 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  58.5 
 
 		 159 aa  176  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  57.82 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 159 aa  176  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.43 
 
 		 333 aa  176  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.72 
 
 		 290 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  52.7 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 211 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 		 183 aa  174  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  54.42 
 
 		 175 aa  174  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  53.74 
 
 		 158 aa  172  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  54.79 
 
 		 178 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  55.1 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  53.06 
 
 		 266 aa  172  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  58.22 
 
 		 212 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  52.05 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  56.46 
 
 		 164 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 184 aa  171  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  55.78 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  56.85 
 
 		 175 aa  170  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 178 aa  170  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  52.74 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  55.1 
 
 		 211 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  55.1 
 
 		 214 aa  169  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50.68 
 
 		 184 aa  168  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  52.05 
 
 		 183 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.08 
 
 		 338 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  51.75 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 		 179 aa  167  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 		 190 aa  167  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.17 
 
 		 322 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 223 aa  166  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  54.48 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 		 213 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.38 
 
 		 334 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 		 213 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 		 179 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.45 
 
 		 176 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.42 
 
 		 309 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 		 204 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  56.16 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.38 
 
 		 334 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 353 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 368 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 209 aa  163  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  54.17 
 
 		 210 aa  163  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 180 aa  163  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 323 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 183 aa  161  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  54.3 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  52.45 
 
 		 220 aa  161  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  51.03 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 305 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  54.67 
 
 		 220 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.570537  decreased coverage  0.0000698173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>