More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3069 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 166 aa  349  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  77.5 
 
 		 168 aa  269  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  74.69 
 
 		 171 aa  268  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  73.49 
 
 		 166 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  73.17 
 
 		 169 aa  266  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  73.62 
 
 		 170 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  73.17 
 
 		 166 aa  262  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  73.01 
 
 		 171 aa  261  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  73.62 
 
 		 169 aa  260  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  72.39 
 
 		 169 aa  256  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  72.67 
 
 		 169 aa  255  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  67.48 
 
 		 168 aa  252  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  70.12 
 
 		 172 aa  251  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  72.05 
 
 		 168 aa  250  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  71.43 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  70.37 
 
 		 168 aa  249  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  68.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  69.51 
 
 		 172 aa  248  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  68.94 
 
 		 168 aa  248  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  70.19 
 
 		 168 aa  247  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  70 
 
 		 173 aa  247  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  68.75 
 
 		 182 aa  245  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  68.32 
 
 		 171 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  68.32 
 
 		 171 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  68.75 
 
 		 175 aa  244  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  69.38 
 
 		 168 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  67.7 
 
 		 171 aa  243  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  67.07 
 
 		 172 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  66.26 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  72.5 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  67.7 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  65 
 
 		 167 aa  237  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  66.46 
 
 		 169 aa  236  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  65.84 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  63.58 
 
 		 162 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  65.84 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  61.59 
 
 		 168 aa  230  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  62.89 
 
 		 167 aa  221  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.67 
 
 		 311 aa  200  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.46 
 
 		 322 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  47.83 
 
 		 162 aa  167  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.59 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  44.83 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  42.51 
 
 		 213 aa  142  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  43.59 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  42.67 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  43.4 
 
 		 178 aa  140  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  41.03 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  42.38 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 		 182 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  42.67 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  39.74 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  43.62 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  42.59 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  41.32 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.58 
 
 		 333 aa  134  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  38.22 
 
 		 180 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  42.59 
 
 		 195 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  40 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  42.28 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  39.19 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.1 
 
 		 351 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.65 
 
 		 290 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  39.87 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  38.71 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 		 181 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  41.78 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  41.06 
 
 		 229 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  38.46 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  41.96 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.52 
 
 		 334 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  39.38 
 
 		 183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.29 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  38.99 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  42.31 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  38.22 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  38.22 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  41.4 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.04 
 
 		 287 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  39.07 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  39.49 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  38.85 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.22 
 
 		 334 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 177 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1027  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.143691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.51 
 
 		 284 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  39.26 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  38.75 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04210  protein-methionine-S-oxide reductase, putative  37.95 
 
 		 192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  38.75 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  39.62 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  41.61 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  38.31 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>