More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1074 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
290 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  75 
 
 
334 aa  471  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  72.22 
 
 
334 aa  448  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  72.57 
 
 
333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  71.18 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.1 
 
 
284 aa  427  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.01 
 
 
287 aa  428  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.73 
 
 
351 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.21 
 
 
306 aa  355  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.39 
 
 
286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.28 
 
 
284 aa  329  4e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.93 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.93 
 
 
289 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.93 
 
 
289 aa  321  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.3 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.28 
 
 
301 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.65 
 
 
301 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.75 
 
 
305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.6 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.55 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.89 
 
 
301 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.25 
 
 
301 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.19 
 
 
309 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.89 
 
 
302 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.89 
 
 
301 aa  295  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.89 
 
 
301 aa  294  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.3 
 
 
300 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.11 
 
 
301 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.94 
 
 
301 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.67 
 
 
311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.06 
 
 
322 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  61.01 
 
 
173 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
178 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  56.33 
 
 
158 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 
180 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.22 
 
 
208 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  52.26 
 
 
184 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  50.94 
 
 
197 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  70.43 
 
 
169 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 
185 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
201 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
249 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  49.38 
 
 
182 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  53.29 
 
 
184 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  53.94 
 
 
236 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 
178 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  57.72 
 
 
150 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  55.19 
 
 
228 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  53.9 
 
 
176 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 
180 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  55.21 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
183 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.8 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 
177 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  53.95 
 
 
266 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
182 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  52.8 
 
 
242 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  54.84 
 
 
228 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  51.48 
 
 
240 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  51.59 
 
 
178 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  55.03 
 
 
155 aa  170  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  49.35 
 
 
190 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 
158 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  50.65 
 
 
181 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  53.8 
 
 
243 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  53.21 
 
 
235 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 
179 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.88 
 
 
229 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  51.23 
 
 
182 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  53.55 
 
 
175 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.8 
 
 
176 aa  169  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  66.38 
 
 
159 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 
216 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  52.73 
 
 
236 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  64.71 
 
 
124 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  52.47 
 
 
225 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
181 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  51.32 
 
 
180 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  53.21 
 
 
156 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  45.99 
 
 
211 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  54.67 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  50.91 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  53.59 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  45.95 
 
 
198 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  53.06 
 
 
162 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 
245 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  49.35 
 
 
181 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  51.66 
 
 
178 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  58.22 
 
 
212 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  49.34 
 
 
186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  62.93 
 
 
124 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  48.39 
 
 
179 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  49.34 
 
 
182 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
180 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  51.92 
 
 
235 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>