More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3068 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 249 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  60.89 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  64.88 
 
 		 234 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  58.85 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  61.68 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  65.05 
 
 		 236 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  63.85 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  60.77 
 
 		 246 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  65.69 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  62.91 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  59.92 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  59.81 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  64.22 
 
 		 236 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  61.27 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  60.78 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  62.14 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  61.46 
 
 		 243 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  57.71 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  61.86 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  52.74 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  50.61 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  56.73 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  56.73 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  50.2 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  50.2 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  61.62 
 
 		 245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  56.94 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  55.51 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.14 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  56.48 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  53.27 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  51.69 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  53.89 
 
 		 198 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  48.94 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  53.37 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 262 aa  209  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  52.76 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.17 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  41.06 
 
 		 208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.62 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.62 
 
 		 301 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  48.54 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.7 
 
 		 301 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.94 
 
 		 338 aa  178  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  46.7 
 
 		 209 aa  178  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.38 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  44.13 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.08 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.88 
 
 		 301 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.37 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.52 
 
 		 185 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 		 178 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  46.47 
 
 		 175 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  44.12 
 
 		 197 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 177 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.03 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.19 
 
 		 333 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.15 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  48.82 
 
 		 189 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.85 
 
 		 334 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  45.96 
 
 		 201 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.43 
 
 		 305 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  52.38 
 
 		 177 aa  164  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.4 
 
 		 334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 181 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  44.64 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 179 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  44.71 
 
 		 181 aa  161  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  47.09 
 
 		 195 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.1 
 
 		 284 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  43.26 
 
 		 180 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 182 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 		 178 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 180 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.33 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 190 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  45.4 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 179 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  43.35 
 
 		 184 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 177 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  41.21 
 
 		 182 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.71 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  38.64 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 		 180 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.05 
 
 		 183 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  43.45 
 
 		 179 aa  158  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.12 
 
 		 305 aa  158  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>