More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2992 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  58.93 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  61.17 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  61.06 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  62.32 
 
 		 235 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  58.19 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 		 236 aa  257  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  65.76 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  57.02 
 
 		 242 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  60.38 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  55.79 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  59.61 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  58.69 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  59.42 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  60.89 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  59.9 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  58.21 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  53.51 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  60.58 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  58.13 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  57.08 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  57.08 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  56.34 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  58.45 
 
 		 247 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  59.59 
 
 		 225 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  52.47 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  53.92 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  56.44 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  51.8 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  50.24 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  53.88 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  52.3 
 
 		 198 aa  185  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  45.93 
 
 		 208 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  44.1 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 		 301 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 		 301 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.29 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.55 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  38.79 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.98 
 
 		 179 aa  165  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  42.39 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 		 177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.11 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.57 
 
 		 301 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.57 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.07 
 
 		 186 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.9 
 
 		 287 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.83 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  43.02 
 
 		 178 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.35 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  42.37 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 182 aa  158  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  40.68 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  41.48 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  41.34 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.33 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  39.5 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  41.92 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  42.46 
 
 		 185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  41.71 
 
 		 180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.61 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  45.03 
 
 		 176 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  42.94 
 
 		 182 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.63 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 		 183 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.03 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.07 
 
 		 177 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 		 181 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  41.86 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  42.53 
 
 		 179 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  42.6 
 
 		 180 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.51 
 
 		 181 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  40.83 
 
 		 184 aa  151  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 181 aa  151  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.68 
 
 		 290 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  40.56 
 
 		 186 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  41.57 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.77 
 
 		 305 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  39.78 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.6 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  42.35 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 		 183 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  44.13 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>