More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3429 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
262 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  58.95 
 
 
216 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  48.58 
 
 
243 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  56.15 
 
 
236 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  56.68 
 
 
235 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  50.97 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  55.03 
 
 
225 aa  218  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
246 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  55.91 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  55.08 
 
 
236 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 
249 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  56.73 
 
 
248 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  51.79 
 
 
245 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 
245 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  54.4 
 
 
211 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  54.4 
 
 
198 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  51.32 
 
 
243 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  56.65 
 
 
176 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  52.41 
 
 
238 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  54.45 
 
 
245 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  51.53 
 
 
246 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  57.23 
 
 
175 aa  204  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  51.76 
 
 
233 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
242 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  52.69 
 
 
234 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  49.74 
 
 
246 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  51.02 
 
 
246 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  54.75 
 
 
197 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  49.75 
 
 
240 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  51.61 
 
 
235 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  53.19 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  52.46 
 
 
180 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  52.6 
 
 
247 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  50.26 
 
 
247 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  52.08 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  52.08 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  48.68 
 
 
246 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  53.25 
 
 
177 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
182 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  52.38 
 
 
225 aa  195  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  51.98 
 
 
180 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  54.6 
 
 
209 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
185 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  54.24 
 
 
246 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  51.98 
 
 
186 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
181 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  52.1 
 
 
178 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 
234 aa  189  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  51.41 
 
 
186 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  51.46 
 
 
182 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  48.31 
 
 
299 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  51.41 
 
 
199 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 
287 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  51.41 
 
 
186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  51.41 
 
 
186 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50.9 
 
 
178 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  51.41 
 
 
186 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  55.81 
 
 
238 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 
185 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 
185 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 
185 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  48.31 
 
 
287 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  52.91 
 
 
293 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  49.71 
 
 
186 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
208 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  53.11 
 
 
240 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
181 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  54.07 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  50.85 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  49.1 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  49.14 
 
 
181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  52.54 
 
 
184 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  49.16 
 
 
228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  50.27 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 
178 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.56 
 
 
225 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  51.16 
 
 
183 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 
178 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  48.63 
 
 
186 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
277 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  51.79 
 
 
182 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  44.39 
 
 
266 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  47.74 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 
195 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 
186 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
184 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 
182 aa  178  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 
184 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  51.19 
 
 
183 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
186 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 
228 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
180 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  45.14 
 
 
179 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 
177 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 
179 aa  175  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  47.95 
 
 
180 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.15 
 
 
305 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.83 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  47.9 
 
 
182 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>