More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3550 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  55.93 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  61 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  61.54 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  59.6 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  60.41 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  58.45 
 
 		 236 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  58.59 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  58.08 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  58.59 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  61.62 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  57.87 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  59.3 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  59.3 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  61.58 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  57.89 
 
 		 247 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  56.65 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  59.3 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  61.05 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  59.11 
 
 		 235 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  58.55 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  52.89 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  53.81 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  57.59 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  58.51 
 
 		 225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  57.81 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  55.1 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  56.63 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  54.08 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  50.24 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  51.79 
 
 		 262 aa  205  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  53.16 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  51.83 
 
 		 211 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  51.83 
 
 		 198 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  49.22 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  47.4 
 
 		 197 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.82 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.67 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  38.79 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  47.34 
 
 		 176 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.26 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.7 
 
 		 301 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.7 
 
 		 301 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  41.55 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.05 
 
 		 301 aa  161  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.05 
 
 		 301 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 178 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.61 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.03 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.03 
 
 		 301 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 		 177 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  36.53 
 
 		 266 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.85 
 
 		 182 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.88 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  42.69 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.27 
 
 		 301 aa  154  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  40.33 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  40.51 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.64 
 
 		 186 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.18 
 
 		 181 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 186 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 180 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  41.04 
 
 		 180 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  41.71 
 
 		 180 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  41.76 
 
 		 190 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  45.81 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  43.68 
 
 		 180 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 		 179 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  44.2 
 
 		 184 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 177 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.17 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  42.94 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  42.33 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.39 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  44.69 
 
 		 177 aa  148  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  42.29 
 
 		 180 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 		 185 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.67 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.61 
 
 		 183 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 		 178 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  40.59 
 
 		 178 aa  148  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 180 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.38 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  42.69 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 191 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>