More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1458 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 236 aa  480  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  87.38 
 
 		 236 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  80.47 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  79.34 
 
 		 236 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  76.17 
 
 		 238 aa  350  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  77.99 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  72.12 
 
 		 234 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  67.25 
 
 		 235 aa  300  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  60.25 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  66.02 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  57.96 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  56.96 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  61.35 
 
 		 233 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  60.87 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  57.78 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 240 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  59.7 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  57.77 
 
 		 245 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  56.52 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  55.29 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  54.88 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  55.29 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  54.81 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  56.85 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 245 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  54.37 
 
 		 246 aa  238  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.57 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 		 243 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  55.61 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  49.78 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  55.03 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  55.03 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  55.08 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  54.64 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  53.89 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  53.76 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  47.98 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.35 
 
 		 301 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.41 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.6 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.82 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  40.28 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 178 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.4 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.4 
 
 		 301 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.4 
 
 		 301 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.98 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  46.59 
 
 		 180 aa  171  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  44 
 
 		 178 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.73 
 
 		 290 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  40.98 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.06 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 		 183 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.59 
 
 		 300 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.3 
 
 		 287 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.86 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  48.24 
 
 		 176 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 201 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 		 184 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.66 
 
 		 305 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.14 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.17 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.32 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  43.35 
 
 		 175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  45.99 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  43.82 
 
 		 186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  45.88 
 
 		 183 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 180 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  45.35 
 
 		 180 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.88 
 
 		 305 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.95 
 
 		 177 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.93 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  47.34 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.92 
 
 		 333 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  44.12 
 
 		 180 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  42.44 
 
 		 180 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  46.29 
 
 		 186 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  43.86 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 179 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  45.05 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.92 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  44.69 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  44.57 
 
 		 179 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.47 
 
 		 176 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>