More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7152 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  87.01 
 
 
235 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  72.06 
 
 
236 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  68.93 
 
 
236 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  66.2 
 
 
240 aa  298  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  68.45 
 
 
238 aa  298  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  64.89 
 
 
243 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  66.19 
 
 
235 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  64.76 
 
 
236 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  64.39 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  63.16 
 
 
248 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  63.73 
 
 
246 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  59.07 
 
 
242 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  64.53 
 
 
245 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  60.79 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  60.89 
 
 
247 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  61.06 
 
 
233 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  59.42 
 
 
247 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  59.42 
 
 
247 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  58.94 
 
 
247 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  53.28 
 
 
245 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  60.4 
 
 
246 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  57.56 
 
 
247 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  60.2 
 
 
225 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  60.78 
 
 
240 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  57.07 
 
 
243 aa  245  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  60.91 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  60.41 
 
 
238 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  56.37 
 
 
246 aa  235  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.82 
 
 
229 aa  234  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  54.9 
 
 
245 aa  231  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  52.75 
 
 
225 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  50.45 
 
 
239 aa  224  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  57.3 
 
 
234 aa  223  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
229 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.69 
 
 
262 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  52.72 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  49.47 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  48.96 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
180 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  39.56 
 
 
266 aa  177  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  45.6 
 
 
197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 
301 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  46.51 
 
 
178 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 
301 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.96 
 
 
182 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 
301 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.21 
 
 
301 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.92 
 
 
290 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.62 
 
 
302 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.02 
 
 
301 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 
180 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  47.98 
 
 
176 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 
228 aa  165  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.05 
 
 
301 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  40.64 
 
 
220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.78 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.05 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.51 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  46.47 
 
 
175 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  44.71 
 
 
190 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  51.18 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  41.21 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  43.96 
 
 
184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  43.75 
 
 
201 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 
182 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.29 
 
 
181 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 
228 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  45.18 
 
 
209 aa  161  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.5 
 
 
338 aa  161  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.62 
 
 
184 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.2 
 
 
305 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
177 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 
181 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.98 
 
 
300 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  43.58 
 
 
204 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 
183 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
179 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  43.86 
 
 
177 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
179 aa  158  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 
184 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  43.35 
 
 
181 aa  158  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  50.34 
 
 
158 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
180 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.41 
 
 
301 aa  158  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  40.22 
 
 
180 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  44.63 
 
 
180 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
182 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 
178 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  43.89 
 
 
186 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
334 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 
210 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  42.2 
 
 
180 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  46.2 
 
 
176 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>