More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1856 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  77.14 
 
 		 235 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  77.29 
 
 		 236 aa  345  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  77.14 
 
 		 240 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  73.36 
 
 		 236 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  75 
 
 		 236 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  68.45 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  68.53 
 
 		 235 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  62.61 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  62.39 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  61.06 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  56.03 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  57.56 
 
 		 246 aa  254  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  58.64 
 
 		 246 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  59.42 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  57.62 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  58.54 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  57.77 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  57.14 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  56.67 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  60.11 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  57.28 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  58.97 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  61.05 
 
 		 245 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  59.16 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  56.04 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  55.94 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  51.71 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  55.26 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  51.35 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  55.61 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  55.61 
 
 		 198 aa  222  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  52.04 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  55.31 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  52.41 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  45.41 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  49.75 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  46.97 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50.57 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.74 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.59 
 
 		 301 aa  184  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.18 
 
 		 301 aa  184  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.92 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.08 
 
 		 301 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  52.33 
 
 		 176 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.7 
 
 		 301 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.88 
 
 		 301 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 		 180 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.88 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 		 183 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.59 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  49.72 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 184 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  49.71 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 		 186 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  49.12 
 
 		 178 aa  179  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  48.35 
 
 		 182 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 		 190 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 179 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  49.13 
 
 		 199 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.92 
 
 		 305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  49.13 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  49.13 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.65 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 181 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  48.84 
 
 		 186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 		 180 aa  171  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 		 181 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 182 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 		 185 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 		 183 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  49.16 
 
 		 186 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  47.09 
 
 		 182 aa  168  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 185 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 287 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  50 
 
 		 299 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 185 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 185 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  47.4 
 
 		 186 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  45.09 
 
 		 175 aa  168  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  50 
 
 		 287 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  53.18 
 
 		 177 aa  168  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 		 228 aa  168  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>