More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5394 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0817  peptide methionine sulfoxide reductase  68.54 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.700063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4498  peptide methionine sulfoxide reductase  67.94 
 
 		 246 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5423  peptide methionine sulfoxide reductase  67.79 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1169  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.745672 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7152  methionine sulfoxide reductase A  65.09 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  61.14 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5717  methionine sulfoxide reductase A  63.16 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210328  normal  0.517272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  59.57 
 
 		 242 aa  279  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6719  methionine sulfoxide reductase A  62.68 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6243  methionine sulfoxide reductase A  62.2 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.997072  normal  0.955536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1588  methionine sulfoxide reductase A  62.2 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5961  methionine sulfoxide reductase A  62.68 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  62.05 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6663  methionine sulfoxide reductase A  60.77 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12314  normal  0.0427735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  61.72 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  60.98 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  62.07 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  60.87 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  60.87 
 
 		 236 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5355  methionine sulfoxide reductase A  60.29 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241935  normal  0.259253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  54.81 
 
 		 246 aa  261  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  61.08 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  60.64 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  55.7 
 
 		 245 aa  241  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  56.63 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  61.67 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  52.89 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 		 229 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2748  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 		 234 aa  236  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  56.22 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0158  methionine sulfoxide reductase A  56.82 
 
 		 225 aa  228  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0173  methionine sulfoxide reductase A  51.27 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.225746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  56.73 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  50.86 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2946  peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  50.86 
 
 		 198 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3402  peptide methionine sulfoxide reductase  48.66 
 
 		 216 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 180 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 178 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.35 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  47.65 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  42.99 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  49.08 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.12 
 
 		 301 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.86 
 
 		 180 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.93 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  46.82 
 
 		 176 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.41 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 		 184 aa  168  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 		 182 aa  168  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.14 
 
 		 182 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.37 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.44 
 
 		 301 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.56 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.08 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.08 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 		 183 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  46.24 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 		 186 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.56 
 
 		 302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 		 186 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 		 178 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  43.93 
 
 		 190 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  45.09 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 		 186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  42.13 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  44.71 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.07 
 
 		 186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  44.57 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  43.26 
 
 		 182 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  45.29 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.74 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  43.53 
 
 		 178 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 186 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 177 aa  161  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 		 175 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.96 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>