More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1080 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
164 aa  338  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  67.7 
 
 
162 aa  226  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  65.16 
 
 
156 aa  219  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  66.45 
 
 
162 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  62.99 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  64.29 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  60.76 
 
 
163 aa  211  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  61.84 
 
 
155 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  61.01 
 
 
165 aa  204  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  60.81 
 
 
150 aa  201  5e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  61.49 
 
 
162 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  54.43 
 
 
208 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  58.71 
 
 
165 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  54.72 
 
 
225 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  56.29 
 
 
157 aa  183  8e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 
266 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  52.9 
 
 
158 aa  179  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  51.27 
 
 
185 aa  179  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  51.23 
 
 
186 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  56.6 
 
 
159 aa  177  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  54.3 
 
 
184 aa  174  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  52.98 
 
 
181 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  54.79 
 
 
176 aa  173  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 
228 aa  173  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  61.07 
 
 
160 aa  173  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  54.67 
 
 
157 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.570537  decreased coverage  0.0000698173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  55.35 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  55.78 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  52.03 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  57.05 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  53.02 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.35 
 
 
333 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  48.78 
 
 
186 aa  170  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 
159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 
159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  54.32 
 
 
229 aa  170  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  51.66 
 
 
178 aa  169  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 
159 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  54.9 
 
 
219 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 
159 aa  168  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 
159 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  55.77 
 
 
159 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
159 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  49.04 
 
 
178 aa  168  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 
159 aa  167  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  56.05 
 
 
220 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 
159 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  55.13 
 
 
159 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  52.35 
 
 
178 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  52.2 
 
 
159 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 
201 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 
177 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  52.6 
 
 
195 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 
183 aa  164  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  51.37 
 
 
228 aa  164  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.69 
 
 
311 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  52.23 
 
 
213 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  53.59 
 
 
164 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  50.94 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  48.75 
 
 
180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  51.63 
 
 
209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  52.67 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  52.32 
 
 
183 aa  163  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  49.68 
 
 
213 aa  163  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  55.13 
 
 
213 aa  163  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  48.77 
 
 
186 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.2 
 
 
184 aa  162  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  52.03 
 
 
211 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  55.19 
 
 
222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  52.56 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  52.53 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  53.46 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 
225 aa  161  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  48.63 
 
 
180 aa  161  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.34 
 
 
338 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  53.7 
 
 
222 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  51.27 
 
 
213 aa  160  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  54.37 
 
 
218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 
211 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0621  peptide methionine sulfoxide reductase  51.9 
 
 
194 aa  160  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  50.62 
 
 
212 aa  160  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  47.56 
 
 
182 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  50.62 
 
 
212 aa  160  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  50.62 
 
 
212 aa  160  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  53.59 
 
 
212 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  52.08 
 
 
220 aa  160  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
214 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  51.27 
 
 
177 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
184 aa  159  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 
179 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  52.53 
 
 
220 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 
215 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  48.15 
 
 
186 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
177 aa  160  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  48.15 
 
 
186 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  51.88 
 
 
215 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>