More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1107 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 157 aa  330  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  91.08 
 
 		 157 aa  308  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  83.44 
 
 		 157 aa  286  6e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.570537  decreased coverage  0.0000698173 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  56.29 
 
 		 164 aa  183  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.05 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  53.38 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 		 208 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  50.99 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  49.01 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  48.08 
 
 		 186 aa  159  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  49.01 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  50.34 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  52.41 
 
 		 266 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 198 aa  157  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 228 aa  156  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  51.66 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.01 
 
 		 287 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  48.08 
 
 		 237 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 		 178 aa  153  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 		 220 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.98 
 
 		 338 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 		 225 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  46.62 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.97 
 
 		 284 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  46.84 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2794  peptide methionine sulfoxide reductase  46.94 
 
 		 177 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.578803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  48.25 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 225 aa  150  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  51.05 
 
 		 185 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 		 219 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  47.74 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.58 
 
 		 334 aa  149  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 191 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  42.11 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.21 
 
 		 334 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 178 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 213 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  43.33 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.65 
 
 		 333 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  45.75 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 		 184 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 		 173 aa  147  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 		 220 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  45 
 
 		 222 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 212 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 		 222 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 		 182 aa  146  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  44.76 
 
 		 180 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 		 220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.58 
 
 		 290 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 223 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 212 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 		 228 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  48 
 
 		 320 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  45.75 
 
 		 222 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  49.66 
 
 		 212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 223 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  48.65 
 
 		 221 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  43.05 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 		 218 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 		 218 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 		 222 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  45.7 
 
 		 229 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 		 212 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 		 218 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  48.3 
 
 		 211 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  44.37 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  43.71 
 
 		 212 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  43.67 
 
 		 212 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  44.87 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 		 220 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  42.58 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 212 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 212 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 212 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>