More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2362 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  61.07 
 
 		 181 aa  207  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  62.75 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  56.69 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  60.54 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  61.07 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  54.3 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.86 
 
 		 351 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  56.16 
 
 		 150 aa  184  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  57.72 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  53.25 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.05 
 
 		 334 aa  178  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  56.76 
 
 		 153 aa  177  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  58.55 
 
 		 223 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  52.17 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  54.04 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  54.04 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.06 
 
 		 334 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.87 
 
 		 284 aa  171  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  54.36 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  53.42 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.55 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  53.42 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 222 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.87 
 
 		 284 aa  170  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.87 
 
 		 290 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.5 
 
 		 333 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  51.37 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  51.55 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  52.17 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  53.02 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  50.31 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  52.53 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  53.95 
 
 		 214 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  56.49 
 
 		 219 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.25 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  53.29 
 
 		 211 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  52.35 
 
 		 180 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.25 
 
 		 284 aa  164  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  55.63 
 
 		 212 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.53 
 
 		 287 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  51.66 
 
 		 212 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  53.02 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 211 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  55.56 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.96 
 
 		 338 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  52.29 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  48.43 
 
 		 198 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 		 212 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  46.05 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  49.07 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  43.4 
 
 		 266 aa  160  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  48.99 
 
 		 175 aa  160  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 		 212 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 		 173 aa  159  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 		 213 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 213 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.06 
 
 		 311 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.62 
 
 		 178 aa  158  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.89 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  55.92 
 
 		 208 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  51.02 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 212 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  54.9 
 
 		 212 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  53.95 
 
 		 212 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.63 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 233 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  48.41 
 
 		 228 aa  157  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  53.29 
 
 		 213 aa  157  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  48.25 
 
 		 228 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  48.65 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  53.33 
 
 		 229 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 		 184 aa  156  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 		 242 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  49.31 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  54.3 
 
 		 213 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  52.41 
 
 		 353 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  53.64 
 
 		 213 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>