More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1541 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
353 aa  734    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  57.51 
 
 
368 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  59.27 
 
 
321 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.97 
 
 
321 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.97 
 
 
321 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  58.97 
 
 
321 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.66 
 
 
321 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  58.97 
 
 
321 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  56.32 
 
 
351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.36 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.66 
 
 
321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  58.36 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.36 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  54.24 
 
 
397 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  54.12 
 
 
394 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  57.01 
 
 
321 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.83 
 
 
416 aa  391  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 
328 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  54.91 
 
 
323 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  51.13 
 
 
381 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  50.28 
 
 
416 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  50.56 
 
 
380 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  56.57 
 
 
320 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  49.59 
 
 
380 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  44.2 
 
 
368 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  45.98 
 
 
375 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  45.67 
 
 
385 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  42.6 
 
 
364 aa  279  5e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  46.11 
 
 
735 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.7 
 
 
352 aa  277  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.33 
 
 
590 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  44.01 
 
 
359 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  41.19 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.2 
 
 
611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  41.1 
 
 
329 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  38.39 
 
 
332 aa  246  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  40 
 
 
316 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  38.96 
 
 
317 aa  239  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  61.05 
 
 
198 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  39.02 
 
 
346 aa  236  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  63.53 
 
 
183 aa  235  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  58.29 
 
 
260 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  39.64 
 
 
338 aa  233  5e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  38.04 
 
 
337 aa  228  8e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
174 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  58.14 
 
 
175 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  37.12 
 
 
309 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  61.08 
 
 
212 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  55.03 
 
 
211 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  53.06 
 
 
211 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  54.69 
 
 
214 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
178 aa  216  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  57.8 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  68.06 
 
 
158 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  57.23 
 
 
242 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
155 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  64.74 
 
 
212 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  71.01 
 
 
187 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  55.49 
 
 
208 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  54.29 
 
 
178 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  67.13 
 
 
290 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  49.48 
 
 
204 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  53.71 
 
 
178 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  36.97 
 
 
309 aa  205  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  65.75 
 
 
202 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  52.57 
 
 
178 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  52.57 
 
 
178 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  53.14 
 
 
178 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  53.14 
 
 
178 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  52.57 
 
 
178 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 
174 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  53.53 
 
 
169 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  51.03 
 
 
198 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 
177 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  50.9 
 
 
177 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  66.91 
 
 
191 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
178 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
178 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  56.95 
 
 
181 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
178 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
213 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  53.85 
 
 
170 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  70.9 
 
 
158 aa  192  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 
153 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  51.48 
 
 
201 aa  191  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  52.25 
 
 
200 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.61 
 
 
311 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  63.91 
 
 
141 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  60.71 
 
 
148 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
175 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  49.11 
 
 
208 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.82 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  67.97 
 
 
154 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 
171 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  59.12 
 
 
167 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  59.12 
 
 
167 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  58.11 
 
 
182 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  64.93 
 
 
150 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 
280 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>