More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2088 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  100 
 
 		 352 aa  732    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  69.4 
 
 		 364 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  59.43 
 
 		 375 aa  425  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  50.55 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  54.11 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  48.81 
 
 		 405 aa  359  4e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  55.16 
 
 		 735 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.03 
 
 		 590 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.14 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.79 
 
 		 611 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.68 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  53.97 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.05 
 
 		 337 aa  332  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.18 
 
 		 317 aa  331  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  50.91 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  52.38 
 
 		 329 aa  318  9e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  49.68 
 
 		 332 aa  308  9e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  50.48 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.1 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  47.62 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 323 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  48.88 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  49.03 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  44.6 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  41.34 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.91 
 
 		 321 aa  291  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 		 321 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.91 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.91 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.91 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.91 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  45.91 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  44.66 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  45.2 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  39.22 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  39.48 
 
 		 380 aa  262  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  38.32 
 
 		 381 aa  262  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  33.17 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  33.17 
 
 		 416 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  67.13 
 
 		 153 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  63.01 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  56.1 
 
 		 166 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  60.96 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 158 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  57.79 
 
 		 170 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  51.9 
 
 		 163 aa  190  4e-47  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  56.86 
 
 		 157 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  56.21 
 
 		 157 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  60.14 
 
 		 187 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 		 147 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 		 147 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  61.81 
 
 		 155 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  60.99 
 
 		 147 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  57.05 
 
 		 152 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  61.7 
 
 		 147 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  61.11 
 
 		 147 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  56.85 
 
 		 148 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  57.93 
 
 		 212 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 		 178 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  61.07 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  57.66 
 
 		 142 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  54.86 
 
 		 158 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 165 aa  177  3e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  54.04 
 
 		 167 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  54.04 
 
 		 167 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 177 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  51.46 
 
 		 176 aa  175  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  60.56 
 
 		 150 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  57.66 
 
 		 142 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  57.66 
 
 		 142 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  56.64 
 
 		 144 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  59.85 
 
 		 148 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  59.85 
 
 		 154 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  56.34 
 
 		 142 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  59.26 
 
 		 141 aa  173  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  58.16 
 
 		 146 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  58.16 
 
 		 146 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  60.87 
 
 		 151 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  53.95 
 
 		 162 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  56.34 
 
 		 191 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  55.48 
 
 		 181 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 142 aa  169  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  58.52 
 
 		 148 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 		 150 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 		 148 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 183 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  57.35 
 
 		 149 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  60.47 
 
 		 148 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 181 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 141 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 157 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  58.21 
 
 		 153 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  48.1 
 
 		 181 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  53.79 
 
 		 202 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 179 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>