More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1363 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  100 
 
 
338 aa  703    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  47.75 
 
 
364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  49.39 
 
 
375 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.23 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  45.54 
 
 
385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.53 
 
 
590 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  47.63 
 
 
735 aa  298  9e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  44.76 
 
 
359 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.11 
 
 
611 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  45.57 
 
 
368 aa  291  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  44.97 
 
 
348 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  46.67 
 
 
316 aa  290  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  43.61 
 
 
332 aa  289  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  46.67 
 
 
346 aa  289  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  45.6 
 
 
309 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  45.43 
 
 
337 aa  285  9e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.13 
 
 
317 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  42.28 
 
 
329 aa  256  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  40.26 
 
 
309 aa  251  1e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  42.77 
 
 
328 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  41.25 
 
 
320 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  40.48 
 
 
368 aa  235  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.62 
 
 
321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  39.64 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  38.61 
 
 
397 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.81 
 
 
321 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.81 
 
 
321 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  39.81 
 
 
321 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  38.31 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  39.69 
 
 
321 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.69 
 
 
321 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  39.38 
 
 
321 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.81 
 
 
321 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.81 
 
 
321 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  39.18 
 
 
321 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  39.62 
 
 
323 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  36.09 
 
 
416 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  39.31 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  34.97 
 
 
416 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  36.86 
 
 
380 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  37.75 
 
 
381 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  39.76 
 
 
351 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  36.71 
 
 
380 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 
142 aa  176  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 
144 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  66.14 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  64.34 
 
 
152 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 
153 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  57.53 
 
 
146 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  57.53 
 
 
146 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  58.74 
 
 
147 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  59.15 
 
 
147 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
142 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  54.42 
 
 
148 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  54.29 
 
 
151 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.03 
 
 
141 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  44.23 
 
 
163 aa  162  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  57.34 
 
 
148 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  52.26 
 
 
186 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.79 
 
 
147 aa  159  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  54.74 
 
 
148 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  53.15 
 
 
148 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  56.34 
 
 
149 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  46.5 
 
 
170 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  53.47 
 
 
158 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.82 
 
 
311 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  58.39 
 
 
149 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  50.34 
 
 
150 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 
166 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  52.45 
 
 
150 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  55.97 
 
 
141 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  53.1 
 
 
158 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 
167 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 
167 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 
153 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  42.04 
 
 
165 aa  150  4e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  56.49 
 
 
153 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 
147 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  54.41 
 
 
154 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  49.34 
 
 
162 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 
147 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  51.28 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 
142 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  55.73 
 
 
153 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 
155 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  56.49 
 
 
157 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 
142 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  51.11 
 
 
142 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.48 
 
 
322 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 
144 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  57.46 
 
 
212 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  53.52 
 
 
147 aa  143  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  41.06 
 
 
157 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  49.28 
 
 
181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.15 
 
 
287 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 
183 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  54.48 
 
 
191 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 
148 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  40.4 
 
 
157 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  55.38 
 
 
187 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>