More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0722 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  100 
 
 
309 aa  637    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.78 
 
 
316 aa  352  4e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  54.75 
 
 
337 aa  338  7e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  50.16 
 
 
348 aa  332  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  52.79 
 
 
346 aa  329  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.08 
 
 
317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  53.53 
 
 
359 aa  323  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  51.79 
 
 
332 aa  318  6e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  50.16 
 
 
375 aa  314  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  50.31 
 
 
364 aa  312  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.2 
 
 
590 aa  300  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  45.87 
 
 
385 aa  296  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  46.06 
 
 
735 aa  291  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  49.84 
 
 
309 aa  291  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  47.12 
 
 
368 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.03 
 
 
352 aa  286  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.2 
 
 
611 aa  285  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  43.69 
 
 
329 aa  265  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  40.26 
 
 
338 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  38.05 
 
 
380 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  36.6 
 
 
397 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  39.68 
 
 
328 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.62 
 
 
321 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  38.11 
 
 
323 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  36.97 
 
 
353 aa  205  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  36.28 
 
 
380 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  35.4 
 
 
381 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  37.87 
 
 
394 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.95 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.95 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  37.95 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  37.95 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  36.59 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  36.57 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  37.62 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  37.95 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.29 
 
 
321 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.62 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.62 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  36.96 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  33.43 
 
 
416 aa  195  9e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  35.06 
 
 
351 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  32.86 
 
 
416 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  56.41 
 
 
170 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  57.24 
 
 
162 aa  177  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  55.76 
 
 
162 aa  170  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  51.59 
 
 
177 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  48.08 
 
 
405 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 
144 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
166 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  52.53 
 
 
157 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  51.92 
 
 
157 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 
147 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 
147 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 
144 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 
153 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
147 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  48.87 
 
 
142 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
153 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
153 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 
157 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
153 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  49.65 
 
 
151 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 
147 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 
142 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 
154 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
148 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  49.04 
 
 
163 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  45.91 
 
 
165 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
150 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  53.72 
 
 
148 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  49.26 
 
 
141 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 
186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 
183 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  46.76 
 
 
152 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  51.2 
 
 
142 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
142 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
142 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.88 
 
 
311 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  47.2 
 
 
158 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 
148 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  48.87 
 
 
202 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  51.24 
 
 
150 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  44.68 
 
 
187 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 
146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 
146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  44.81 
 
 
180 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  51.24 
 
 
181 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  48.12 
 
 
148 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  52.07 
 
 
148 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
179 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 
149 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  41.1 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  46.27 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
181 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  45.19 
 
 
141 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.81 
 
 
338 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
178 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000703  methionine sulfoxide reductase  43.42 
 
 
157 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 
181 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>