More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1633 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  100 
 
 
346 aa  716    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  71.55 
 
 
348 aa  531  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  67.05 
 
 
337 aa  473  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  66.88 
 
 
317 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  61.34 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.55 
 
 
316 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  54.72 
 
 
309 aa  368  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  51.88 
 
 
375 aa  346  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.91 
 
 
611 aa  345  6e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  51.1 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  53.67 
 
 
364 aa  341  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  49.86 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.6 
 
 
590 aa  335  5e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  54.31 
 
 
352 aa  330  3e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  52.79 
 
 
309 aa  329  4e-89  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  44.18 
 
 
385 aa  319  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  46.69 
 
 
735 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  46.67 
 
 
338 aa  289  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  45.1 
 
 
329 aa  277  2e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  42.27 
 
 
320 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  44.34 
 
 
328 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  35.61 
 
 
397 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  38.68 
 
 
394 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.5 
 
 
321 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  39.02 
 
 
353 aa  236  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  42.07 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  41.1 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  41.75 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.1 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.1 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 
321 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  41.1 
 
 
321 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  36.39 
 
 
380 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  36.86 
 
 
381 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  40.52 
 
 
323 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  33.42 
 
 
416 aa  227  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  38.15 
 
 
368 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  40 
 
 
351 aa  226  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  33.17 
 
 
416 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  60.87 
 
 
162 aa  216  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  33.95 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  58.02 
 
 
170 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  62.59 
 
 
151 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  59.42 
 
 
142 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  62.04 
 
 
153 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  52.53 
 
 
177 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  59.7 
 
 
141 aa  178  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  54.78 
 
 
157 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  54.78 
 
 
157 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  58.99 
 
 
147 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  48.02 
 
 
405 aa  176  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  51.55 
 
 
165 aa  176  5e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  63.24 
 
 
144 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  52.87 
 
 
162 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  57.35 
 
 
152 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  57.55 
 
 
147 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  54.01 
 
 
144 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  53.69 
 
 
181 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  58.65 
 
 
148 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 
141 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  57.89 
 
 
147 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  57.89 
 
 
147 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  52.74 
 
 
202 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  57.94 
 
 
142 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.9 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
150 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  55.07 
 
 
158 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  54.89 
 
 
148 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
153 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  58.59 
 
 
153 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  55.32 
 
 
148 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 
148 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.29 
 
 
147 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 
163 aa  161  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  53.62 
 
 
155 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  57.89 
 
 
148 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  57.81 
 
 
153 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
154 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 
146 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 
146 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
157 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  51.03 
 
 
187 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
166 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  55.64 
 
 
149 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  53.52 
 
 
212 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 
150 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  54.48 
 
 
149 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 
142 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  52.82 
 
 
147 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 
167 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 
167 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
158 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  47.47 
 
 
186 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  48.34 
 
 
290 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  46.1 
 
 
156 aa  150  4e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 
142 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 
142 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>