More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1045 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
364 aa  758    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  69.4 
 
 
352 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 
375 aa  414  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.99 
 
 
316 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  50.98 
 
 
368 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  51.83 
 
 
348 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  52.87 
 
 
735 aa  358  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  48.23 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  55.03 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.19 
 
 
590 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  55.27 
 
 
337 aa  354  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  46.68 
 
 
405 aa  352  7e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.55 
 
 
611 aa  352  8e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.27 
 
 
317 aa  347  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  53.23 
 
 
329 aa  342  5e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  53.67 
 
 
346 aa  341  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  49.07 
 
 
332 aa  332  9e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  47.75 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  50.31 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  48.6 
 
 
323 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.26 
 
 
321 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  46.18 
 
 
320 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  44.6 
 
 
380 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  41.83 
 
 
381 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.04 
 
 
321 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  45.72 
 
 
368 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  47.04 
 
 
321 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  47.04 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.04 
 
 
321 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.04 
 
 
321 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.04 
 
 
321 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.04 
 
 
321 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  46.73 
 
 
321 aa  285  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  46.73 
 
 
321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  47.78 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  43.47 
 
 
380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  46.42 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  41.42 
 
 
394 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  42.6 
 
 
353 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  43.02 
 
 
397 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  43.33 
 
 
351 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  38.27 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  39.83 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
153 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  68.18 
 
 
147 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  68.18 
 
 
147 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  65.93 
 
 
147 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  55.83 
 
 
166 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  66.42 
 
 
147 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  59.59 
 
 
311 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  62.24 
 
 
147 aa  192  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  56.13 
 
 
154 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  61.94 
 
 
148 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  61.59 
 
 
150 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  56.38 
 
 
152 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  59.86 
 
 
158 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  53.9 
 
 
212 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  59.59 
 
 
153 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  60.4 
 
 
181 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  59.48 
 
 
170 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  65.67 
 
 
148 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  61.87 
 
 
146 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  61.87 
 
 
146 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  58.9 
 
 
153 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  58.9 
 
 
153 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  61.48 
 
 
148 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  55.35 
 
 
186 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 
150 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  60.29 
 
 
157 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  57.24 
 
 
155 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  63.16 
 
 
148 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  58.55 
 
 
157 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  58.04 
 
 
144 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  52.32 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  58.55 
 
 
157 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  64.06 
 
 
142 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  58.45 
 
 
187 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 
142 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  59.71 
 
 
144 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  54.05 
 
 
202 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  53.55 
 
 
163 aa  179  5.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  60.45 
 
 
141 aa  179  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  60.14 
 
 
149 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  59.72 
 
 
167 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  59.72 
 
 
167 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  58.5 
 
 
149 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  57.34 
 
 
151 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  56.16 
 
 
148 aa  176  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  59.12 
 
 
142 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  59.12 
 
 
142 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.03 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  59.12 
 
 
142 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
177 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  52.6 
 
 
162 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 
158 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  58.99 
 
 
141 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  57.78 
 
 
147 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  54.73 
 
 
151 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 
179 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>