More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  100 
 
 
385 aa  799    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  66.87 
 
 
735 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  52.25 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
375 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  48.01 
 
 
405 aa  359  4e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  48.23 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.15 
 
 
611 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.09 
 
 
352 aa  350  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  47.45 
 
 
359 aa  350  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.26 
 
 
316 aa  346  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.55 
 
 
590 aa  342  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  49.24 
 
 
348 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.93 
 
 
317 aa  334  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  50.63 
 
 
329 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  47.71 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  45.92 
 
 
332 aa  322  6e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  44.18 
 
 
346 aa  319  5e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  45.96 
 
 
394 aa  305  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  45.54 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  41.56 
 
 
397 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  45.87 
 
 
309 aa  296  4e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  43.29 
 
 
309 aa  294  2e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  46.39 
 
 
351 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  44.16 
 
 
380 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  45.67 
 
 
353 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  39.84 
 
 
368 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.23 
 
 
416 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
380 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  45.4 
 
 
328 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  44 
 
 
323 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 
381 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  39.78 
 
 
416 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  42.6 
 
 
320 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.34 
 
 
321 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  43.03 
 
 
321 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.72 
 
 
321 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.72 
 
 
321 aa  252  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 
321 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 
321 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.41 
 
 
321 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.41 
 
 
321 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 
321 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.11 
 
 
321 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  41.3 
 
 
321 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  57.69 
 
 
157 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  57.05 
 
 
157 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  62.16 
 
 
155 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  61.64 
 
 
158 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
166 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  66.17 
 
 
148 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 
162 aa  187  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  65.93 
 
 
147 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  65.93 
 
 
147 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  53.12 
 
 
170 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  60.28 
 
 
153 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  57.64 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 
158 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  57.93 
 
 
152 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.83 
 
 
311 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  58.87 
 
 
187 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  61.03 
 
 
150 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  60.9 
 
 
148 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  55.17 
 
 
212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 
147 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  62.69 
 
 
186 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  61.07 
 
 
147 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
148 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  56.64 
 
 
202 aa  173  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.29 
 
 
322 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 
150 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  59.09 
 
 
142 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  61.9 
 
 
142 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  58.09 
 
 
141 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  61.54 
 
 
148 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 
154 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  61.19 
 
 
146 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  61.19 
 
 
146 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  56.06 
 
 
142 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  56.06 
 
 
142 aa  169  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 
149 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  54.48 
 
 
181 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 
148 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  55.3 
 
 
142 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  53.9 
 
 
144 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  58.7 
 
 
151 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  60.9 
 
 
153 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  60.9 
 
 
153 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  60.9 
 
 
153 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  48.72 
 
 
163 aa  166  5e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  46.5 
 
 
165 aa  166  5e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  55.47 
 
 
141 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  58.21 
 
 
147 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  56.12 
 
 
151 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  48.72 
 
 
156 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  59.54 
 
 
157 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  56.03 
 
 
149 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 
177 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
167 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
167 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  53.62 
 
 
191 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>