More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1043 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  100 
 
 		 416 aa  862    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  91.83 
 
 		 416 aa  802    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  63.37 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  53.87 
 
 		 368 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  51.25 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  50.83 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  47.5 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  49.3 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  49.58 
 
 		 380 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  50.14 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  47.19 
 
 		 320 aa  348  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  45.48 
 
 		 323 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.48 
 
 		 321 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  45.89 
 
 		 328 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 		 321 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 		 321 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.44 
 
 		 321 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  44.79 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.07 
 
 		 321 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  45.07 
 
 		 321 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.07 
 
 		 321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.07 
 
 		 321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.17 
 
 		 321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  44.23 
 
 		 321 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  39.1 
 
 		 735 aa  279  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  39.23 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.35 
 
 		 611 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  38.27 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  40.69 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  40.38 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.57 
 
 		 590 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  35.88 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  38.86 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  37.71 
 
 		 329 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  35.65 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  35.09 
 
 		 348 aa  239  8e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  33.42 
 
 		 346 aa  227  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  35.77 
 
 		 317 aa  226  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  36.09 
 
 		 338 aa  222  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  34.45 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  35.08 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  53.63 
 
 		 183 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  62.14 
 
 		 187 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 211 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  61.7 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 		 198 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 212 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  33.43 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  52.02 
 
 		 175 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  51.45 
 
 		 174 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 		 174 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 		 212 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 204 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  51.18 
 
 		 177 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  51.18 
 
 		 177 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  52.07 
 
 		 201 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 178 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 178 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  63.36 
 
 		 167 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  63.36 
 
 		 167 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 178 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  58.57 
 
 		 158 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  55.21 
 
 		 191 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 		 214 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  45.9 
 
 		 223 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  58.57 
 
 		 155 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 178 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 		 178 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  49.71 
 
 		 202 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  48.31 
 
 		 178 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 		 178 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 		 213 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 		 178 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 		 178 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  47.75 
 
 		 178 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 		 211 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  53.21 
 
 		 181 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  63.77 
 
 		 158 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  49.7 
 
 		 208 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 148 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  49.42 
 
 		 208 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  31.25 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  46.07 
 
 		 178 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  56.62 
 
 		 141 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  57.86 
 
 		 152 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  48.5 
 
 		 169 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.5 
 
 		 242 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  55.32 
 
 		 212 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  49.71 
 
 		 191 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 		 198 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  45.45 
 
 		 191 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 		 175 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 		 178 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 183 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 185 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  60.47 
 
 		 154 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.29 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>