More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1000 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
174 aa  363  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  89.35 
 
 
177 aa  324  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  89.35 
 
 
177 aa  324  3e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  61.4 
 
 
183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  59.88 
 
 
323 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  59.06 
 
 
175 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  58.05 
 
 
174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.49 
 
 
321 aa  218  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
328 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  59.88 
 
 
178 aa  217  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
321 aa  217  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  58.24 
 
 
321 aa  216  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
178 aa  215  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  57.49 
 
 
178 aa  215  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
178 aa  215  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.28 
 
 
321 aa  215  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
178 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
321 aa  215  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
321 aa  215  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  59.28 
 
 
178 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  58.68 
 
 
321 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.28 
 
 
321 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.28 
 
 
321 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.28 
 
 
321 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 
178 aa  213  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.68 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  56.89 
 
 
201 aa  212  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 
178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 
178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 
178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  58.08 
 
 
178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  56.14 
 
 
198 aa  209  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  52.87 
 
 
320 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  50.9 
 
 
353 aa  201  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
394 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  53.57 
 
 
260 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 
368 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 
397 aa  197  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  52.63 
 
 
416 aa  195  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.63 
 
 
416 aa  194  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  48.82 
 
 
169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 
380 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
175 aa  186  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  48.52 
 
 
351 aa  185  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  48.82 
 
 
212 aa  185  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  49.06 
 
 
183 aa  184  8e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
381 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  48.85 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  49.7 
 
 
242 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  46.78 
 
 
380 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  50.31 
 
 
280 aa  180  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
180 aa  178  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 
214 aa  174  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 
211 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  47.7 
 
 
208 aa  173  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  48.24 
 
 
212 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  48.5 
 
 
173 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  44.71 
 
 
170 aa  169  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
171 aa  168  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  47.59 
 
 
208 aa  168  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
198 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  44.31 
 
 
213 aa  167  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  50.32 
 
 
171 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.67 
 
 
197 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  48.39 
 
 
169 aa  164  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  48.39 
 
 
169 aa  164  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
204 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1596  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
156 aa  164  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 
181 aa  163  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 
177 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  47.62 
 
 
186 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  47.62 
 
 
178 aa  160  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 
198 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46.26 
 
 
186 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  41.57 
 
 
223 aa  157  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 
184 aa  157  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 
180 aa  156  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  45.58 
 
 
176 aa  156  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  46.62 
 
 
181 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 
178 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 
266 aa  155  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.98 
 
 
180 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  45.58 
 
 
228 aa  154  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
184 aa  154  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  44.67 
 
 
225 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 
200 aa  153  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  43.6 
 
 
191 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  43.62 
 
 
182 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  43.02 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 
150 aa  151  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  47.59 
 
 
201 aa  151  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.97 
 
 
185 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  45.03 
 
 
175 aa  149  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  43.54 
 
 
180 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  47.26 
 
 
184 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  39.11 
 
 
226 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>