More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0104 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  404  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  95.81 
 
 
191 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  55.84 
 
 
211 aa  230  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  55.15 
 
 
212 aa  227  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  56.25 
 
 
204 aa  226  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  58.24 
 
 
214 aa  216  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  58.48 
 
 
211 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  56.32 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  48.17 
 
 
198 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  55.62 
 
 
208 aa  204  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  52.98 
 
 
242 aa  201  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  50.53 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  52.84 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  50.26 
 
 
198 aa  195  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  48.3 
 
 
380 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  43.63 
 
 
368 aa  185  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.35 
 
 
197 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  45.79 
 
 
208 aa  184  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
380 aa  182  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  51.79 
 
 
213 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
416 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
196 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  50.87 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  46.89 
 
 
183 aa  177  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.52 
 
 
416 aa  177  8e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
394 aa  177  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 
174 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  47.95 
 
 
353 aa  175  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  44.56 
 
 
223 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  44.2 
 
 
381 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 
211 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  41.03 
 
 
212 aa  174  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  50.58 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  48.81 
 
 
397 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  45.18 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  43.08 
 
 
195 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  46.24 
 
 
323 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  46.24 
 
 
320 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 
209 aa  168  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.2 
 
 
321 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  45.3 
 
 
198 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  41.58 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  42.49 
 
 
351 aa  164  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  47.65 
 
 
170 aa  164  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  46.89 
 
 
328 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  47.93 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 
321 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  43.52 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  45.61 
 
 
321 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
178 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
178 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 
321 aa  160  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  47.4 
 
 
178 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
321 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
178 aa  158  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  48.99 
 
 
178 aa  158  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  40.61 
 
 
203 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
178 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.44 
 
 
321 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
178 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  42.69 
 
 
203 aa  157  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.86 
 
 
321 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  40.61 
 
 
203 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  38.05 
 
 
226 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  49.34 
 
 
197 aa  156  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  43.86 
 
 
321 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
178 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.44 
 
 
321 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  44.44 
 
 
321 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
175 aa  155  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  43.27 
 
 
321 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.03 
 
 
290 aa  154  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 
177 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 
177 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  43.02 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.03 
 
 
334 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 
153 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
333 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  47.27 
 
 
173 aa  150  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  35.64 
 
 
201 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
184 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.65 
 
 
322 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
181 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  39.56 
 
 
226 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 
178 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 
180 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  52.05 
 
 
176 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.32 
 
 
338 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  48.34 
 
 
171 aa  148  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 
184 aa  148  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  42.69 
 
 
169 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  42.69 
 
 
169 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 
225 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.81 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  48.3 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>