More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3242 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
213 aa  443  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  55.45 
 
 
198 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  51.67 
 
 
226 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  52.24 
 
 
223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  55.37 
 
 
242 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  50.8 
 
 
226 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  49.16 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  54.49 
 
 
198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  47.52 
 
 
200 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  44.12 
 
 
204 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  47.5 
 
 
351 aa  175  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.15 
 
 
212 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  45.63 
 
 
197 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  44.56 
 
 
191 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  44.15 
 
 
214 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  44.15 
 
 
211 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  43.84 
 
 
196 aa  168  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  44.1 
 
 
198 aa  168  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  43.68 
 
 
191 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  41.9 
 
 
211 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  36.74 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  39.9 
 
 
203 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  42.08 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  45.6 
 
 
183 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  43.06 
 
 
195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  43.4 
 
 
212 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  39.42 
 
 
203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  44.32 
 
 
368 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  45.64 
 
 
209 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  44.2 
 
 
320 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  44.13 
 
 
323 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.86 
 
 
321 aa  157  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  41.55 
 
 
208 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  42.39 
 
 
198 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  37.44 
 
 
201 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  41.88 
 
 
353 aa  154  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  40.66 
 
 
321 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 
213 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  44.69 
 
 
328 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  43.78 
 
 
175 aa  152  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  39.69 
 
 
380 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 
321 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 
321 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15191  peptide methionine sulfoxide reductase  39.29 
 
 
200 aa  151  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0163481  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1431  peptide methionine sulfoxide reductase  38.78 
 
 
200 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  42.7 
 
 
203 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  40.22 
 
 
321 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  42.22 
 
 
174 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  39.15 
 
 
380 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.78 
 
 
321 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 
183 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  40.88 
 
 
260 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  41.11 
 
 
174 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  40.22 
 
 
321 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  39.07 
 
 
223 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 
175 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15331  peptide methionine sulfoxide reductase  39.78 
 
 
200 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  41.62 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  39.66 
 
 
178 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  40.22 
 
 
178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 
178 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  41.11 
 
 
178 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  39.66 
 
 
178 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  45.52 
 
 
178 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  40.78 
 
 
178 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  36.65 
 
 
381 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  45.52 
 
 
178 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 
180 aa  143  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  39.44 
 
 
177 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  40.43 
 
 
394 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  39.44 
 
 
177 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  36.84 
 
 
397 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  41.76 
 
 
208 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  45.21 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  38.55 
 
 
178 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  38.55 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  38.55 
 
 
178 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  44.59 
 
 
280 aa  137  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  46.94 
 
 
171 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.35 
 
 
338 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.71 
 
 
334 aa  136  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  44.83 
 
 
169 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 
169 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 
169 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  43.24 
 
 
173 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.36 
 
 
416 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  37.36 
 
 
416 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  43.84 
 
 
171 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  39.78 
 
 
170 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 
178 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0092  peptide methionine sulfoxide reductase  42.31 
 
 
157 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.570537  decreased coverage  0.0000698173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  43.62 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  47.92 
 
 
182 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.91 
 
 
176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 
197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.67 
 
 
333 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>