More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06690 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 380 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  86.05 
 
 		 380 aa  688    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  70.16 
 
 		 381 aa  551  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  68.85 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  52.65 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  49.35 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  49.58 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.58 
 
 		 416 aa  378  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  47.96 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.13 
 
 		 321 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  48.42 
 
 		 320 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  48.4 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  46.96 
 
 		 321 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  48.08 
 
 		 323 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  46.96 
 
 		 321 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.96 
 
 		 321 aa  345  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 		 321 aa  345  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.96 
 
 		 321 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.67 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  46.38 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.67 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.38 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  46.38 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  45.35 
 
 		 368 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  44.6 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  44.11 
 
 		 735 aa  287  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  40.72 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  39.37 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.51 
 
 		 590 aa  260  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.77 
 
 		 611 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  38.32 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.95 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  40.65 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  40.06 
 
 		 317 aa  228  9e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  36.15 
 
 		 348 aa  228  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  36.1 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  36.86 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  34.79 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  33.95 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  65.99 
 
 		 155 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  64.63 
 
 		 158 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  35.84 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  65.07 
 
 		 181 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  67.38 
 
 		 187 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  36.28 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  62.24 
 
 		 290 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 212 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  54.32 
 
 		 202 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  67.15 
 
 		 167 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  67.15 
 
 		 167 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  35.22 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  46.04 
 
 		 211 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  62.04 
 
 		 141 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 183 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  45.54 
 
 		 214 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  60.56 
 
 		 191 aa  192  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  55.86 
 
 		 148 aa  192  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  45 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  48.33 
 
 		 198 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 212 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  60.42 
 
 		 152 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  50.3 
 
 		 242 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 		 174 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  44.33 
 
 		 198 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  42.13 
 
 		 212 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 175 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  48.3 
 
 		 191 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  48.3 
 
 		 191 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  47.78 
 
 		 209 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  45.61 
 
 		 223 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  46.78 
 
 		 174 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 177 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 		 177 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  45.65 
 
 		 260 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  58.45 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  48.48 
 
 		 178 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  61.36 
 
 		 157 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 		 153 aa  179  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  44.62 
 
 		 212 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  48.52 
 
 		 208 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  56.76 
 
 		 150 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 178 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 178 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 178 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 178 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  42.59 
 
 		 223 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 178 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 178 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  42.39 
 
 		 201 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  41.79 
 
 		 208 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  41.62 
 
 		 204 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 		 178 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 154 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  57.66 
 
 		 158 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  53.29 
 
 		 184 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  59.7 
 
 		 153 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  59.7 
 
 		 153 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 178 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>