More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1198 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
175 aa  367  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  71.76 
 
 
201 aa  261  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  72.67 
 
 
171 aa  253  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  68.82 
 
 
169 aa  246  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  63.79 
 
 
173 aa  229  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  64.71 
 
 
180 aa  228  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  60.23 
 
 
183 aa  221  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  57.71 
 
 
178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  57.71 
 
 
178 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.06 
 
 
321 aa  210  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  57.8 
 
 
178 aa  209  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  56.57 
 
 
323 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  56.65 
 
 
178 aa  208  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  58.48 
 
 
174 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  57.8 
 
 
178 aa  208  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  60 
 
 
280 aa  207  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  57.23 
 
 
178 aa  206  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  56 
 
 
178 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1596  peptide methionine sulfoxide reductase  65.19 
 
 
156 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  56 
 
 
178 aa  204  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  56 
 
 
178 aa  204  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 
175 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  55.23 
 
 
320 aa  204  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  56.65 
 
 
178 aa  203  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  56.65 
 
 
178 aa  203  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  56.4 
 
 
183 aa  203  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  57.31 
 
 
321 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.31 
 
 
321 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.31 
 
 
321 aa  201  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  57.31 
 
 
321 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  57.31 
 
 
321 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.73 
 
 
321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.73 
 
 
321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  56.57 
 
 
321 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  53.14 
 
 
177 aa  198  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  53.14 
 
 
177 aa  198  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  56.14 
 
 
321 aa  198  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.73 
 
 
321 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  53.53 
 
 
198 aa  191  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  53.85 
 
 
368 aa  190  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
353 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
214 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  50.88 
 
 
211 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  50.29 
 
 
174 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 
328 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 
169 aa  183  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 
169 aa  183  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  49.7 
 
 
242 aa  181  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  50.6 
 
 
212 aa  180  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  50.29 
 
 
397 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
208 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  53.12 
 
 
171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  50.89 
 
 
212 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
416 aa  174  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
260 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.26 
 
 
416 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 
211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
204 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 
198 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  45.35 
 
 
351 aa  167  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  47.06 
 
 
170 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  47.93 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
178 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 
200 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  49.33 
 
 
208 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
208 aa  158  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  43.68 
 
 
197 aa  157  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  48.68 
 
 
181 aa  156  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  45.93 
 
 
191 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  45.35 
 
 
191 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  48.99 
 
 
266 aa  154  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  48.98 
 
 
182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 
177 aa  153  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 
225 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 
228 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 
183 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 
178 aa  151  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.32 
 
 
176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.65 
 
 
209 aa  150  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  44.51 
 
 
197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
203 aa  150  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 
186 aa  149  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
394 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 
156 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.77 
 
 
184 aa  148  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 
223 aa  148  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 
186 aa  147  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
177 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  45.03 
 
 
180 aa  148  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  45.1 
 
 
182 aa  147  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  48.3 
 
 
185 aa  147  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  40.72 
 
 
381 aa  147  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 
182 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.3 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  41.71 
 
 
209 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  40.7 
 
 
223 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.37 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>