More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2955 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  55.45 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  52.12 
 
 		 242 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  50.6 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  45.23 
 
 		 212 aa  178  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  45.69 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  49.47 
 
 		 223 aa  173  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  48.45 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  45.5 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  43.16 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  44.16 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  41.41 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  43.15 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  45.95 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  41.41 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  46.53 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  45.98 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  43.43 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  42.44 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  42.44 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  48.21 
 
 		 368 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 320 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 397 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  41.88 
 
 		 381 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.82 
 
 		 321 aa  162  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  42.56 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  43.68 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  43.01 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  43.79 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  43.5 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  42.64 
 
 		 394 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.94 
 
 		 416 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  47.4 
 
 		 328 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  46.11 
 
 		 351 aa  158  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  45.83 
 
 		 183 aa  157  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  42.26 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  44.64 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  43.6 
 
 		 323 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15191  peptide methionine sulfoxide reductase  37.63 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0163481  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15331  peptide methionine sulfoxide reductase  39.69 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  44.07 
 
 		 353 aa  154  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  39.78 
 
 		 416 aa  154  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  39.06 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1431  peptide methionine sulfoxide reductase  37.11 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  42.6 
 
 		 321 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  42.6 
 
 		 321 aa  151  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.6 
 
 		 321 aa  151  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.6 
 
 		 321 aa  151  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  42.69 
 
 		 195 aa  151  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  47.67 
 
 		 175 aa  151  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  38.35 
 
 		 380 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  42.01 
 
 		 321 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.6 
 
 		 321 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  42.01 
 
 		 321 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  37.86 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.6 
 
 		 321 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  42.6 
 
 		 321 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  42.01 
 
 		 321 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  42.94 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 178 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  44.64 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  43.53 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 180 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  43.6 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  44.12 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  41.38 
 
 		 203 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 178 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  43.02 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  43.45 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  44.67 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  44.67 
 
 		 169 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  44.3 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  40.33 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  44 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  43.84 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  41.28 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  42 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  45.21 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  39.53 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  42.11 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  38.29 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  39.77 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>