More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2879 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  53.46 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  54.38 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  49.77 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  52.24 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  53.11 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.59 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  49.74 
 
 		 195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 		 198 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  50.84 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  44.6 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  47.25 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  47.46 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.28 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 380 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  42.59 
 
 		 380 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  42.47 
 
 		 381 aa  175  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 		 198 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  49.47 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  44.74 
 
 		 353 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  49.15 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  46.96 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  50.57 
 
 		 323 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 		 368 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  47.16 
 
 		 328 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  47.49 
 
 		 321 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.04 
 
 		 321 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 196 aa  168  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  46.93 
 
 		 321 aa  167  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  43.35 
 
 		 204 aa  167  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.93 
 
 		 321 aa  167  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  40.98 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  41.58 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  46.93 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  45.81 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.93 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.93 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  41.38 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  44.21 
 
 		 178 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 211 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  43.39 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.37 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  43.07 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  45.76 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  43.39 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  44.21 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  43.68 
 
 		 178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  44.38 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  43.68 
 
 		 178 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  43.68 
 
 		 178 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  44.63 
 
 		 214 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  42.63 
 
 		 178 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  42.63 
 
 		 178 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 		 177 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  42.63 
 
 		 178 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 		 177 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  45.25 
 
 		 416 aa  158  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  41.57 
 
 		 174 aa  157  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.25 
 
 		 416 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  40.58 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  43.72 
 
 		 397 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  42.7 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  42.62 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  47.95 
 
 		 171 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  39.89 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  42.22 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 175 aa  148  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.15 
 
 		 333 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.95 
 
 		 338 aa  148  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  46.58 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  46.58 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15191  peptide methionine sulfoxide reductase  39.78 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0163481  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  36.97 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  47.59 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  37.82 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 		 173 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15331  peptide methionine sulfoxide reductase  39.38 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.99 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  46.62 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 334 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  48.63 
 
 		 180 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  48.25 
 
 		 169 aa  142  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1431  peptide methionine sulfoxide reductase  38.71 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 183 aa  141  8e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.16 
 
 		 284 aa  141  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07826  hypothetical protein  41.57 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  37.26 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  38.1 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>