More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2482 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2482  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
213 aa  443  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000558183  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  53.81 
 
 
212 aa  224  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1188  peptide methionine sulfoxide reductase  61.76 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000171924  decreased coverage  0.000921348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  52.94 
 
 
214 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  60.61 
 
 
242 aa  218  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 
211 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  49.06 
 
 
368 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  59.52 
 
 
212 aa  214  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
223 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  52.04 
 
 
211 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3441  peptide methionine sulfoxide reductase  59.65 
 
 
198 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1295  peptide methionine sulfoxide reductase  52.04 
 
 
200 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  54.22 
 
 
204 aa  198  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  47.21 
 
 
394 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
353 aa  194  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2990  peptide methionine sulfoxide reductase  50.59 
 
 
198 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 
208 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  48.57 
 
 
416 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0859  peptide methionine sulfoxide reductase  54.27 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.57 
 
 
416 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  50.3 
 
 
323 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  45.02 
 
 
397 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.4 
 
 
321 aa  184  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2436  peptide methionine sulfoxide reductase  52.44 
 
 
198 aa  184  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.228717  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0118  hypothetical protein  51.79 
 
 
191 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  52.33 
 
 
328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  42.93 
 
 
381 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0104  hypothetical protein  51.79 
 
 
191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  50.61 
 
 
175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  50.61 
 
 
174 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  51.83 
 
 
320 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  48.48 
 
 
321 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.47 
 
 
321 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 
321 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  46.47 
 
 
321 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  47.06 
 
 
321 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  48.48 
 
 
321 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.47 
 
 
321 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1688  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
178 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.47 
 
 
321 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.47 
 
 
321 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1663  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
178 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1885  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 
178 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1443  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.27 
 
 
321 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
211 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1711  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
178 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0559  methionine sulfoxide reductase A  45.1 
 
 
212 aa  176  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1846  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
178 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1964  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
178 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1931  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
178 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1125  peptide methionine sulfoxide reductase  46.77 
 
 
201 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000367889  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05541  peptide methionine sulfoxide reductase  42.86 
 
 
223 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.771006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1704  peptide methionine sulfoxide reductase  48.54 
 
 
178 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1848  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
178 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1538  peptide methionine sulfoxide reductase  51.61 
 
 
180 aa  174  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0351426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3494  peptide methionine sulfoxide reductase  47.95 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1422  methionine sulfoxide reductase A  52.67 
 
 
169 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
380 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1450  methionine sulfoxide reductase A  52.67 
 
 
169 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.58381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  45 
 
 
351 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  46.39 
 
 
380 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1513  methionine sulfoxide reductase A  47.27 
 
 
177 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2114  peptide methionine sulfoxide reductase  49.41 
 
 
209 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905031  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1484  methionine sulfoxide reductase A  47.27 
 
 
177 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0931  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 
171 aa  168  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1000  methionine sulfoxide reductase A  44.31 
 
 
174 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2879  peptide methionine sulfoxide reductase  43.18 
 
 
223 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1645  peptide methionine sulfoxide reductase  50.99 
 
 
183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1198  peptide methionine sulfoxide reductase  47.93 
 
 
175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.675663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2288  methionine sulfoxide reductase A  49.33 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0508  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1510  methionine sulfoxide reductase A  45.24 
 
 
169 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0697517  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  45.56 
 
 
196 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384494  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2955  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
198 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1184  peptide methionine sulfoxide reductase  46.43 
 
 
203 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368364  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14941  peptide methionine sulfoxide reductase  36.36 
 
 
201 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.579151  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0746  peptide methionine sulfoxide reductase  39.22 
 
 
195 aa  157  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 
203 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 
171 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10418  predicted protein  46.15 
 
 
170 aa  154  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.487316  normal  0.0313973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  40.44 
 
 
226 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  44.97 
 
 
203 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  46.45 
 
 
181 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.39 
 
 
184 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 
178 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15191  peptide methionine sulfoxide reductase  35.89 
 
 
200 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0163481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3242  peptide methionine sulfoxide reductase  38.01 
 
 
213 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  46.62 
 
 
153 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.1 
 
 
284 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15331  peptide methionine sulfoxide reductase  35.9 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3468  peptide methionine sulfoxide reductase  38.12 
 
 
226 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1431  peptide methionine sulfoxide reductase  35.41 
 
 
200 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  44.08 
 
 
181 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 
155 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  40.11 
 
 
225 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.53 
 
 
284 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  44.12 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>