More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4592 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
368 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  52.25 
 
 
385 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  54.97 
 
 
735 aa  384  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  50.14 
 
 
375 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  50.98 
 
 
364 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  50.14 
 
 
359 aa  365  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.37 
 
 
352 aa  360  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.92 
 
 
316 aa  352  7e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.72 
 
 
590 aa  351  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  51.1 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  50.63 
 
 
348 aa  342  5e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.55 
 
 
611 aa  341  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  47.38 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  49.68 
 
 
337 aa  326  5e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  47.37 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.37 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  44.2 
 
 
353 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  48.14 
 
 
332 aa  315  9e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  45.07 
 
 
368 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  41.67 
 
 
416 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  39.8 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  46.55 
 
 
380 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  40.64 
 
 
416 aa  298  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  45.4 
 
 
394 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  47.6 
 
 
323 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  47.76 
 
 
309 aa  295  1e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
380 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  45.57 
 
 
338 aa  291  8e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  50.32 
 
 
328 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  46.22 
 
 
351 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.42 
 
 
321 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  47.12 
 
 
309 aa  288  1e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  44.18 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  46.3 
 
 
321 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  46.6 
 
 
320 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.47 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  46.47 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.66 
 
 
321 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  45.66 
 
 
321 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.66 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 
321 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.66 
 
 
321 aa  272  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  44.34 
 
 
321 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  62.5 
 
 
170 aa  215  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
158 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  64.34 
 
 
153 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.03 
 
 
311 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  63.45 
 
 
158 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  62.76 
 
 
155 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  60 
 
 
181 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  61.7 
 
 
290 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  61.22 
 
 
212 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  61.38 
 
 
152 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  63.31 
 
 
187 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  57.69 
 
 
157 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  51.22 
 
 
177 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  63.45 
 
 
154 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  62.76 
 
 
150 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  57.69 
 
 
157 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  60.81 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 
157 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 
148 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  53.7 
 
 
166 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  63.85 
 
 
141 aa  179  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  58.16 
 
 
202 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  59.57 
 
 
147 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  60.61 
 
 
142 aa  177  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  62.79 
 
 
147 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  58.74 
 
 
147 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  62.79 
 
 
147 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  65.12 
 
 
153 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  55.28 
 
 
186 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  65.12 
 
 
153 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  59.42 
 
 
191 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  65.12 
 
 
153 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  58.21 
 
 
141 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  61.43 
 
 
151 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  59.85 
 
 
167 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  59.85 
 
 
167 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  50.31 
 
 
162 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 
144 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 
165 aa  168  2e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  49.39 
 
 
183 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 
142 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 
142 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
148 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  57.46 
 
 
149 aa  166  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  58.21 
 
 
149 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
180 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  53.68 
 
 
142 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  53.68 
 
 
142 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  48.75 
 
 
178 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
148 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 
150 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  49.4 
 
 
179 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
148 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  53.1 
 
 
146 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  55.64 
 
 
148 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  53.1 
 
 
146 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>