More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3070 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
150 aa  311  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  73.47 
 
 
148 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  75.68 
 
 
148 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  74.31 
 
 
146 aa  234  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  74.31 
 
 
146 aa  234  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  73.79 
 
 
148 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  71.14 
 
 
149 aa  230  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  69.59 
 
 
148 aa  229  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  71.43 
 
 
149 aa  228  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  71.72 
 
 
147 aa  226  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  68.97 
 
 
147 aa  223  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  65.97 
 
 
147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  65.94 
 
 
153 aa  204  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  65.94 
 
 
153 aa  204  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  65.94 
 
 
153 aa  203  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  65.94 
 
 
157 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  62.59 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  60.99 
 
 
150 aa  190  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  63.12 
 
 
151 aa  186  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  64.66 
 
 
364 aa  185  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  61.87 
 
 
186 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  61.03 
 
 
385 aa  176  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
375 aa  176  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  61.72 
 
 
152 aa  174  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  55.24 
 
 
158 aa  174  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  59.7 
 
 
153 aa  174  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  59.56 
 
 
321 aa  174  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  66.13 
 
 
142 aa  174  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  61.36 
 
 
735 aa  174  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  173  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
321 aa  172  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  58.09 
 
 
321 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
321 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.82 
 
 
321 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 
397 aa  171  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  58.82 
 
 
321 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  60.77 
 
 
147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  59.09 
 
 
142 aa  170  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  60.15 
 
 
348 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  59.54 
 
 
147 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.35 
 
 
321 aa  169  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  57.35 
 
 
332 aa  169  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  62.02 
 
 
328 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.7 
 
 
590 aa  167  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  59.69 
 
 
352 aa  167  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 
351 aa  167  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  59.09 
 
 
141 aa  166  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  57.14 
 
 
346 aa  166  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  55.63 
 
 
155 aa  165  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
323 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.78 
 
 
611 aa  163  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  57.46 
 
 
394 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  56.39 
 
 
368 aa  163  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  55.97 
 
 
380 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  58.52 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  57.78 
 
 
380 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.36 
 
 
311 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  58.21 
 
 
320 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  58.52 
 
 
337 aa  161  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  52.38 
 
 
316 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  59.68 
 
 
144 aa  159  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  55.97 
 
 
317 aa  159  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 
142 aa  159  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
359 aa  159  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 
368 aa  159  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.38 
 
 
147 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  55.64 
 
 
202 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  55.32 
 
 
167 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  55.32 
 
 
167 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  54.07 
 
 
381 aa  157  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  56.06 
 
 
151 aa  157  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  58.02 
 
 
144 aa  157  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  54.35 
 
 
181 aa  156  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  52.08 
 
 
148 aa  156  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  57.36 
 
 
290 aa  156  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  50.34 
 
 
338 aa  155  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  54.89 
 
 
353 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.74 
 
 
322 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 
405 aa  153  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 
142 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1512  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 
142 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  54.2 
 
 
141 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  50.36 
 
 
416 aa  151  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.75 
 
 
416 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
187 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 
309 aa  146  8e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  51.88 
 
 
212 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 
191 aa  140  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  50.75 
 
 
329 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  55.46 
 
 
143 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  55.46 
 
 
143 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  55.46 
 
 
206 aa  137  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  54.62 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  51.24 
 
 
309 aa  135  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  54.62 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>