More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1687 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  100 
 
 
170 aa  352  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.37 
 
 
590 aa  230  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 
368 aa  215  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  58.08 
 
 
316 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.67 
 
 
611 aa  209  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  58.23 
 
 
735 aa  208  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  58.75 
 
 
359 aa  206  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  57.86 
 
 
405 aa  204  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  58.02 
 
 
346 aa  197  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  57.41 
 
 
348 aa  193  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  58.02 
 
 
317 aa  192  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  54.37 
 
 
375 aa  192  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 
177 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  58.71 
 
 
157 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  60.39 
 
 
166 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  58.06 
 
 
157 aa  191  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.5 
 
 
332 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  59.48 
 
 
364 aa  187  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  56.88 
 
 
162 aa  186  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  54.32 
 
 
337 aa  186  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  53.12 
 
 
385 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  56.41 
 
 
309 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.79 
 
 
352 aa  179  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  52.26 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  48.82 
 
 
183 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  50.63 
 
 
163 aa  170  6.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
180 aa  163  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  52.26 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 
156 aa  159  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
180 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 
181 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  44.77 
 
 
179 aa  158  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 
181 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  46.5 
 
 
338 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  48.77 
 
 
309 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  49.4 
 
 
329 aa  156  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  47.1 
 
 
175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.58 
 
 
182 aa  150  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.39 
 
 
322 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  43.9 
 
 
176 aa  147  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  43.37 
 
 
180 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  42.01 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3367  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/MsrB  47.8 
 
 
456 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  42.59 
 
 
178 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  43.42 
 
 
191 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  41.94 
 
 
181 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.52 
 
 
416 aa  142  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  43.64 
 
 
186 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  42.67 
 
 
184 aa  142  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 
162 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.86 
 
 
338 aa  142  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  44.37 
 
 
156 aa  141  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  39.88 
 
 
182 aa  141  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  46.26 
 
 
240 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  45.03 
 
 
228 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.68 
 
 
290 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  41.51 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0267  peptide methionine sulfoxide reductase  40.76 
 
 
197 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  43.95 
 
 
177 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 
201 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0786  methionine sulfoxide reductase A  44.31 
 
 
168 aa  138  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  44.14 
 
 
416 aa  139  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  43.79 
 
 
159 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  47.68 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.05 
 
 
311 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.49 
 
 
351 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  44.9 
 
 
245 aa  137  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  38.15 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  42.58 
 
 
199 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 
186 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  39.88 
 
 
184 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 
186 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3869  peptide methionine sulfoxide reductase  42.76 
 
 
208 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2454  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
182 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  41.92 
 
 
182 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 
186 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  39.88 
 
 
178 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  39.16 
 
 
228 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  43.4 
 
 
220 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 
165 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 
186 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  44.37 
 
 
177 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  43.79 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  44.44 
 
 
299 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 
225 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
293 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  42.59 
 
 
277 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44 
 
 
186 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.86 
 
 
333 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
287 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>