More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2913 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  98.73 
 
 
157 aa  319  7e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  60.26 
 
 
359 aa  197  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
385 aa  197  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  58.71 
 
 
170 aa  192  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  60.13 
 
 
166 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  53.85 
 
 
405 aa  187  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  53.9 
 
 
735 aa  187  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
368 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 
177 aa  187  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  58.55 
 
 
364 aa  185  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  56.05 
 
 
162 aa  184  6e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.86 
 
 
352 aa  181  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  54.78 
 
 
346 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  53.25 
 
 
375 aa  178  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  53.85 
 
 
337 aa  175  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.85 
 
 
317 aa  174  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.87 
 
 
348 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  51.61 
 
 
163 aa  169  1e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  52.6 
 
 
316 aa  168  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  51.92 
 
 
156 aa  166  1e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.68 
 
 
611 aa  165  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
156 aa  165  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.59 
 
 
590 aa  165  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  51.61 
 
 
183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  48.08 
 
 
332 aa  159  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  49.04 
 
 
212 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  56.05 
 
 
162 aa  157  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  49.68 
 
 
219 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  52.53 
 
 
309 aa  155  2e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  50.68 
 
 
175 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  46.84 
 
 
221 aa  154  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 
181 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 
181 aa  154  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  50.32 
 
 
309 aa  154  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 
179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 
164 aa  152  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
179 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
178 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  46.2 
 
 
220 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  48.03 
 
 
329 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
163 aa  150  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  51.95 
 
 
165 aa  151  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0740  methionine sulfoxide reductase A  51.3 
 
 
165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0698569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  48.7 
 
 
222 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
180 aa  150  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  47.97 
 
 
181 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  47.5 
 
 
211 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  44.87 
 
 
216 aa  149  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 
186 aa  149  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  47.4 
 
 
222 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  48.05 
 
 
222 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  47.4 
 
 
240 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 
150 aa  149  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  45.57 
 
 
218 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  44.23 
 
 
158 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 
180 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  47.33 
 
 
229 aa  148  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  44.1 
 
 
162 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  48.41 
 
 
212 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  49.35 
 
 
221 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 
223 aa  147  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  42.68 
 
 
176 aa  146  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  43.31 
 
 
222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 
218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 
191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 
218 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  44 
 
 
219 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1362  methionine sulfoxide reductase A  49.35 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.526795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 
216 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  44.72 
 
 
238 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 
162 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 
220 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 
184 aa  144  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  45.57 
 
 
217 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.1 
 
 
185 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  46.05 
 
 
155 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  44.3 
 
 
212 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.47 
 
 
351 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  46.5 
 
 
218 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 
178 aa  144  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 
177 aa  142  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 
217 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  44.16 
 
 
162 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  43.67 
 
 
215 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  46.2 
 
 
217 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  47.33 
 
 
186 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  41.06 
 
 
338 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  46.54 
 
 
228 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  41.94 
 
 
175 aa  141  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 
180 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  42.68 
 
 
212 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  44.81 
 
 
162 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  42 
 
 
182 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  44.24 
 
 
446 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  41.4 
 
 
212 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  43.04 
 
 
215 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>