More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3161 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 162 aa  339  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  78.4 
 
 		 162 aa  273  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  67.7 
 
 		 164 aa  226  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  63.64 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  63.16 
 
 		 155 aa  207  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  61.04 
 
 		 158 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  57.05 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  58.55 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  58.11 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  54.49 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  52.47 
 
 		 208 aa  181  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  58.55 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  55.33 
 
 		 225 aa  180  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  54.72 
 
 		 165 aa  178  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  54.42 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  55.48 
 
 		 229 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  57.52 
 
 		 219 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  57.24 
 
 		 164 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  54.36 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  59.87 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  58.71 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  54.72 
 
 		 220 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  56.05 
 
 		 222 aa  168  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  52.23 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  57.42 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  55.41 
 
 		 211 aa  167  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  52.9 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  55.92 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 228 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 		 225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.01 
 
 		 333 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  51.35 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  53.21 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.69 
 
 		 334 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 		 186 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  50.96 
 
 		 213 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 		 211 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  55.92 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  57.72 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.34 
 
 		 351 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 266 aa  161  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.01 
 
 		 290 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  52.2 
 
 		 215 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.32 
 
 		 284 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  52.23 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  51.03 
 
 		 186 aa  160  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  56.41 
 
 		 217 aa  160  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  53.06 
 
 		 186 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 		 321 aa  160  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  53.8 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.03 
 
 		 321 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  51.28 
 
 		 220 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  54.09 
 
 		 213 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  50.96 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  51.61 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  51.35 
 
 		 323 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 		 321 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  53.9 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  53.42 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  50.34 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 		 212 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  47.74 
 
 		 321 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 		 321 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  45.68 
 
 		 182 aa  158  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 		 321 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 		 214 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  52.63 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  52.63 
 
 		 212 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  51.92 
 
 		 191 aa  158  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  49.36 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  49.36 
 
 		 220 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  50.32 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  48.39 
 
 		 321 aa  157  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  52.9 
 
 		 212 aa  157  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.99 
 
 		 284 aa  157  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 		 180 aa  157  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  48.73 
 
 		 217 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  45.89 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.74 
 
 		 321 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 		 220 aa  156  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.03 
 
 		 287 aa  156  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.74 
 
 		 321 aa  156  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  49.68 
 
 		 212 aa  156  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  49.32 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>