More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0268 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 162 aa  339  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  78.4 
 
 		 162 aa  273  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  66.45 
 
 		 164 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  62.58 
 
 		 156 aa  209  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  63.87 
 
 		 158 aa  203  9e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  61.18 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  59.21 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  61.69 
 
 		 165 aa  191  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  57.62 
 
 		 181 aa  191  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  56.77 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  53.9 
 
 		 208 aa  187  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  56.76 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 		 185 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  55.62 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  54.97 
 
 		 225 aa  179  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  54.73 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  54.72 
 
 		 229 aa  173  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  49.03 
 
 		 266 aa  170  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  53.25 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  53.33 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  56.21 
 
 		 219 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  57.42 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  51.97 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  57.89 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  53.75 
 
 		 215 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  51.37 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  56.21 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  56.13 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  56.13 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  51.22 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  52.35 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  52.74 
 
 		 177 aa  163  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  54.05 
 
 		 211 aa  163  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  47.97 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  55.48 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  52.9 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  53.64 
 
 		 334 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  52.35 
 
 		 290 aa  162  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  47.02 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  53.29 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  51.57 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  51.57 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  51.57 
 
 		 212 aa  160  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  52.2 
 
 		 216 aa  160  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 220 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  50.61 
 
 		 212 aa  160  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.98 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  48.32 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  54.14 
 
 		 212 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  48.61 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  48.68 
 
 		 262 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  53.16 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  52.15 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  48.78 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  53.59 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  51.35 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  52.5 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 212 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  53.25 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.99 
 
 		 338 aa  157  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  53.95 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  51.95 
 
 		 222 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 180 aa  157  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  52.23 
 
 		 213 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 		 212 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.67 
 
 		 284 aa  157  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  50.61 
 
 		 212 aa  156  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  51.39 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  51.88 
 
 		 222 aa  156  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0106  peptide methionine sulfoxide reductase  52.23 
 
 		 217 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.145566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  52.94 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.35 
 
 		 333 aa  156  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  49.1 
 
 		 213 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  51.59 
 
 		 213 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  49.69 
 
 		 213 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  49.36 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.68 
 
 		 284 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  50.67 
 
 		 195 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  50.96 
 
 		 220 aa  154  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>