More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1933 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 		 159 aa  337  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  86.79 
 
 		 159 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  83.65 
 
 		 159 aa  296  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  83.65 
 
 		 159 aa  296  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  83.65 
 
 		 159 aa  296  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  83.02 
 
 		 159 aa  294  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 		 159 aa  294  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 		 159 aa  294  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 		 159 aa  294  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 		 159 aa  292  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 		 159 aa  290  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  81.13 
 
 		 159 aa  290  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  82.39 
 
 		 159 aa  285  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  78.48 
 
 		 164 aa  275  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  77.36 
 
 		 159 aa  268  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  73.58 
 
 		 159 aa  261  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  73.58 
 
 		 159 aa  256  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  56.13 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  54.14 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  56.6 
 
 		 164 aa  177  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  57.82 
 
 		 150 aa  174  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  54.19 
 
 		 163 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  52.67 
 
 		 225 aa  170  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  53.29 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  54.67 
 
 		 155 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  55.92 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  51.35 
 
 		 228 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 185 aa  163  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  52.38 
 
 		 184 aa  162  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  53.33 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  49.36 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  53.42 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  49.69 
 
 		 181 aa  161  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.47 
 
 		 301 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  52.26 
 
 		 222 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  53.25 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  50.67 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  51.95 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.43 
 
 		 197 aa  157  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 		 266 aa  156  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  48.1 
 
 		 180 aa  156  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  50.68 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.68 
 
 		 290 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  48 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.13 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 		 223 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 211 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50.66 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.8 
 
 		 184 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  46.98 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  48.65 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  48.67 
 
 		 178 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.84 
 
 		 300 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 		 260 aa  151  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  48.08 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.79 
 
 		 305 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 397 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.03 
 
 		 334 aa  150  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  51.55 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.68 
 
 		 333 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  48.65 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  50.96 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  46.94 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 		 220 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  49.66 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.79 
 
 		 351 aa  147  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  46.58 
 
 		 213 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  48.1 
 
 		 213 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  48.3 
 
 		 353 aa  147  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  43.59 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  50.67 
 
 		 221 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  47.33 
 
 		 368 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  46.71 
 
 		 220 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 		 201 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  46.26 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  47.17 
 
 		 212 aa  144  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.69 
 
 		 311 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2651  peptide methionine sulfoxide reductase  48.67 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  46.41 
 
 		 220 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  49.01 
 
 		 212 aa  144  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  48.72 
 
 		 216 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.65 
 
 		 309 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  47.68 
 
 		 213 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0807  peptide methionine sulfoxide reductase  48 
 
 		 174 aa  143  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.88 
 
 		 301 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>