More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1502 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
166 aa  344  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  60.37 
 
 
375 aa  211  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  55.83 
 
 
364 aa  196  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  57.52 
 
 
405 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  54.94 
 
 
359 aa  193  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  60.13 
 
 
157 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  60.39 
 
 
170 aa  192  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
385 aa  191  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  59.48 
 
 
157 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.1 
 
 
352 aa  189  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  54.37 
 
 
735 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  53.7 
 
 
368 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  51.3 
 
 
163 aa  179  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
165 aa  176  1e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 
177 aa  175  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  51.95 
 
 
316 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.9 
 
 
590 aa  171  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  52.9 
 
 
317 aa  169  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  55.63 
 
 
162 aa  169  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  50.62 
 
 
329 aa  167  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.71 
 
 
611 aa  167  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  54.25 
 
 
348 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.87 
 
 
337 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  49.67 
 
 
346 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  52.26 
 
 
162 aa  157  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  49.68 
 
 
309 aa  156  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  44.51 
 
 
338 aa  155  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  47.06 
 
 
156 aa  154  6e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  50.96 
 
 
309 aa  153  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  49.01 
 
 
332 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4512  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 
218 aa  151  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 
178 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  45.91 
 
 
212 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  46.84 
 
 
223 aa  147  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0684  methionine sulfoxide reductase A  47.8 
 
 
228 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.909394  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1140  peptide methionine sulfoxide reductase  47.17 
 
 
221 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 
219 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  41.94 
 
 
183 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.81 
 
 
334 aa  143  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.52 
 
 
334 aa  142  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  41.45 
 
 
191 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3605  peptide methionine sulfoxide reductase  48.68 
 
 
219 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3480  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
219 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  42.21 
 
 
176 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  48.05 
 
 
216 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2177  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 
221 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.532726 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1312  methionine sulfoxide reductase A  45.22 
 
 
218 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000106862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  44.65 
 
 
212 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  46.45 
 
 
211 aa  141  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  47.02 
 
 
220 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
213 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
213 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.16 
 
 
338 aa  140  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  44.59 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3281  peptide methionine sulfoxide reductase  48.03 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  44.94 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  47.92 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  44.16 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  45.57 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1074  peptide methionine sulfoxide reductase  43.29 
 
 
215 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.813448  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0861  peptide methionine sulfoxide reductase  45.75 
 
 
220 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.595619  normal  0.0630155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  46.1 
 
 
212 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.75 
 
 
351 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.33 
 
 
186 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 
179 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
220 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  45.7 
 
 
225 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
222 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  46.36 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1069  methionine sulfoxide reductase A  43.31 
 
 
218 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1007  methionine sulfoxide reductase A  43.31 
 
 
218 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.59 
 
 
290 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  39.74 
 
 
186 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2261  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 
211 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.366504 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  42.95 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  42.77 
 
 
218 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08180  methionine-S-sulfoxide reductase  42.24 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0834233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0153  peptide methionine sulfoxide reductase  42.31 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  44 
 
 
186 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  42.95 
 
 
212 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  42.95 
 
 
212 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  45.27 
 
 
175 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4941  methionine sulfoxide reductase A  43.98 
 
 
218 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  42.95 
 
 
212 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  38.31 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  41.88 
 
 
238 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  38.31 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0918  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 
220 aa  134  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.121013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  43.31 
 
 
213 aa  134  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5755  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 
215 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66330  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 
215 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  42.11 
 
 
178 aa  133  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  39.35 
 
 
179 aa  133  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  43.67 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  45.03 
 
 
215 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  45.7 
 
 
222 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13107  predicted protein  43.97 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09051  peptide methionine sulfoxide reductase  46.21 
 
 
242 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>